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张冰宝

新虫 (小有名气)

[求助] 连接克隆载体提取质粒结果跑出两条带 已有6人参与

最近在做质粒的构建,将目地片段连接到pmd-18t中。连了很多次,每次16度连接过夜,后转化到感受态细胞中,挑菌过夜后进行菌液pcr,每次都有很多杂带出现,目的条带也不是很亮。于是提质粒鉴定,提出的质粒是两条带,一条带大小是我的目的条带,一条带大小是我的载体条带。好几次都是这种结果。不知道是什么原因?
1:为什么提取质粒的条带与双酶切的跑胶结果是一样的呢?这说明我是连接上了还是没连接上啊?
2:如果没有连接上,连接的是空载体,不是应该只有空载体的一个带吗?大小在2600bp处。为什么还会有我的目的条带呢?
3:如果连接上了,提的质粒应该不能把载体和片段断开吧?
实在是不知道怎么回事?请高手帮帮忙分析一下。十万火急
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dongdekun

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
张冰宝(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-11-05 14:27:01
1)正常提取的质粒跑电泳是好几条带的,直接电泳,跟Marker比大小是没有参考性的。
2)如果想看质粒大小(一般没必要),可以单酶切再跑电泳。
3)质粒鉴定一般结合:菌落(液)PCR + 质粒双酶切 + 测序。。。
祝好运。
5楼2014-11-03 23:29:05
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dongdekun

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 张冰宝 at 2014-11-05 08:44:28
单酶切证实是空载体。应该是没连上吧...

是否使用蓝白斑筛选,白斑比例有多高?
如果菌液PCR非特异扩增多,目的条带不亮,基本上可以判断为假阳性(引物原因除外)?
多挑几个白斑,菌液或者菌落PCR,目的条带很亮的,才用来提质粒酶切或者测序。
9楼2014-11-05 08:55:30
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