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卡西西VS鸣人

金虫 (小有名气)

[求助] 连接载体转化后挑单菌落,菌落pcr扩出条带,但是摇菌摇不起来 已有3人参与

载体是连接有EGFP的瞬时表达载体,有氨苄抗性。转化到DH5α中,涂含氨苄的平板。倒置培养12个小时候未见菌落,但是17个小时候有菌落,且密度不是很大,单菌落数不多不少的样子。我先是挑单菌落摇菌,准备做菌液pcr,但是37°C转速200培养过夜之后LB培养基仍然是清亮的,没有任何菌生长。再挑单菌落,换了别人配的LB震荡培养,仍然是没有摇起来。最后我挑单菌落加到20μl的水中做菌落pcr,设置了空白对照,pcr结果显示空白对照没有条带,其它菌落pcr只有两个未扩出条带。将pcr条带最亮的几管分别加到4mlLB培养基中,再加入4μl氨苄,37°C振荡培养过夜。最后居然还是没有菌落生长,培养基一片清亮······
我在网上查到说,挑单菌落的时候可能挑到平板上未干的连接液,连接液里可能含有未连接到载体上的目的片段,所以pcr可以扩出条带。但是我很确定我挑到了菌落,肉眼看到菌落慢慢的分散开来然后水变浑浊。即使是空载,摇菌应该也能摇起来。平板是刚刚倒的,氨苄的作用肯定存在。氨苄也没问题,别人刚用过我直接拿过来用的,别人的结果没出问题。
以前挑过很多次菌,菌液pcr也做过,,都没有发生这种状况。我觉得我的操作没有问题,但是实在是找不到原因了,哪位高手给指点一下啊……
昨天刚刚又转化了一次,现在已经有14个小时了,肉眼只能看到几个小菌落。一般来说12个小时应该就长得差不多了。转化涂板用的是新配制的氨苄板,菌落生长缓慢会不会是感受态细菌的问题呢?细菌没有接受外源抗性质粒的活性了,但还是能缓慢的在含氨苄的平板上生长,在含有氨苄的LB液体培养基里培养24个小时也不会快速的生长。是不是这样呢?
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zero19871029

新虫 (小有名气)

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★ ★
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kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-09-24 17:42:44
这次做菌P的时候建议挑取单菌落先划板,然后在长出的板子上挑菌做菌P,这样可以有效避免假阳性,毕竟做转化的时候涂到板子上的不单纯是菌液还有连接产物,这个跟个人操作没有关系,没有人能保证挑到单菌落的同时能避免沾到残留的连接产物
2楼2014-09-24 17:28:10
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putao57819

新虫 (初入文坛)

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卡西西VS鸣人(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励发帖交流 2014-11-29 20:53:19
建议检查载体有没有问题,培养这么长时间才长出的菌落可能是污染的杂菌。可以在做转化的时候同时转化一个没有插入片段的空载体做对照。
3楼2014-09-25 19:10:53
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hmily890404

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
卡西西VS鸣人(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励发帖交流 2014-11-29 20:53:28
氨苄板长起来很快的。。我前阵子也在连EGFP,12个小时足足狗狗了。17个小时再长出来的。。应该已经不是你要的了。。能P出条带来也是正常,因为我那时候做的时候也是,里面压根没有EGFP,还生生的给我拉出了差不多大小的条带来,后来测序出来什么都没有,真是醉了。。感觉根据你的描述真心找不到啥问题,要不EGFP载体出了问题,要不感受态有问题。。EGFP你重新鉴定一下吧。如果正确,那就换批感受态。。再者。。我也没办法啦!
4楼2014-11-29 20:29:01
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baishujun

新虫 (初入文坛)

5楼2016-04-18 21:30:23
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冉冉升起93

新虫 (初入文坛)

楼主,你解决了吗?我也遇到了同样的问题啊啊啊
生物物理
6楼2016-11-03 11:17:16
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