应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 求助 已知真菌基因组DNA序列如何预测cDNA序列？
51/1返回列表
查看: 1571  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

katrina_yao

铁虫 (初入文坛)

[求助] 求助 已知真菌基因组DNA序列如何预测cDNA序列？ 已有1人参与

请教各位，如何根据已知真菌基因组DNA序列预测cDNA序列，怎样才能预测到哪些是内含子，然后设计相应的特异性引物对反转录的cDNA进行PCR。谢谢啦~
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2014-09-18 22:58:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

katrina_yao

铁虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by liuderong at 2014-09-18 23:17:21
试一下NCBI里头的blastX，应该可以大概给出一些同源蛋白，然后根据保守区推测开放阅读框。http://blast.st-va.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PROGRAM=blastx&PAGE_TYPE=BlastSearch&LINK_LOC=blasthome...

能否说具体些呢？得到了这样一个图，但我不会分析了···
求助 已知真菌基因组DNA序列如何预测cDNA序列？
QQ图片20140919202635.jpg
赞一下 回复此楼
3楼2014-09-19 20:27:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
katrina_yao(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-09-19 16:35:08
试一下NCBI里头的blastX，应该可以大概给出一些同源蛋白，然后根据保守区推测开放阅读框。http://blast.st-va.ncbi.nlm.nih. ... ;LINK_LOC=blasthome
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

katrina_yao
2楼2014-09-18 23:17:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liuderong

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by katrina_yao at 2014-09-19 20:27:00
能否说具体些呢？得到了这样一个图，但我不会分析了···

QQ图片20140919202635.jpg
...

你的基因里有一个比较明显的PKS结构域。网站的结果里除了这个图外还会给出一些相似度比较高的蛋白序列，你仔细看看，找出这些相似高的蛋白就以它们为基础推测你的目的序列。
赞一下 回复此楼
4楼2014-09-19 22:53:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

katrina_yao

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by liuderong at 2014-09-19 22:53:24
你的基因里有一个比较明显的PKS结构域。网站的结果里除了这个图外还会给出一些相似度比较高的蛋白序列，你仔细看看，找出这些相似高的蛋白就以它们为基础推测你的目的序列。...

那是根据相似性高的蛋白的cDNA序列去推测我要的目的cDNA序列吗？
赞一下 回复此楼
5楼2014-09-24 10:30:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 0856调剂，是学校就去 +6 sllhht 2026-03-19 7/350 2026-03-19 19:50 by 制度的
[考博] 东华理工大学化材专业26届硕士博士申请 +8 zlingli 2026-03-13 8/400 2026-03-19 16:32 by 轻松不少随
[考研] 271材料工程求调剂 +6 .6lL 2026-03-18 6/300 2026-03-19 15:41 by haoshis
[考研] 266求调剂 +5 阳阳哇塞 2026-03-14 10/500 2026-03-19 15:08 by 阳阳哇塞
[考研] 一志愿天津大学化学工艺专业（081702）315分求调剂 +11 yangfz 2026-03-17 11/550 2026-03-19 15:06 by houyaoxu
[考研] 求调剂 +3 Mqqqqqq 2026-03-19 3/150 2026-03-19 14:11 by peike
[考研] 287求调剂 +3 晨昏线与星海 2026-03-19 4/200 2026-03-19 12:32 by peike
[考研] 一志愿中海洋材料工程专硕330分求调剂 +7 小材化本科 2026-03-18 7/350 2026-03-19 10:46 by Linda Hu
[考研] 332求调剂 +3 ydfyh 2026-03-17 3/150 2026-03-19 10:14 by 功夫疯狂
[考研] 0703化学调剂，求各位老师收留 +10 秋有木北 2026-03-14 10/500 2026-03-19 05:52 by anny19840123
[考研] 085600材料与化工 +5 安全上岸！ 2026-03-16 5/250 2026-03-18 15:33 by cmz0325
[考研] 0854可跨调剂，一作一项核心论文五项专利，省、国级证书40+数一英一287 +8 小李0854 2026-03-16 8/400 2026-03-18 14:35 by 搏击518
[考研] 280求调剂 +6 咕噜晓晓 2026-03-18 7/350 2026-03-18 11:25 by 无际的草原
[考研] 0703化学求调剂 总分331 +3 ZY-05 2026-03-13 3/150 2026-03-18 10:58 by macy2011
[考研] 277调剂 +5 自由煎饼果子 2026-03-16 6/300 2026-03-17 19:26 by 李leezz
[考研] 考研化学学硕调剂，一志愿985 +4 张vvvv 2026-03-15 6/300 2026-03-17 17:15 by ruiyingmiao
[考研] 308求调剂 +4 是Lupa啊 2026-03-16 4/200 2026-03-17 17:12 by ruiyingmiao
[考研] 材料专硕326求调剂 +6 墨煜姒莘 2026-03-15 7/350 2026-03-17 17:10 by ruiyingmiao
[考研] 材料工程专硕274一志愿211求调剂 +6 薛云鹏 2026-03-15 6/300 2026-03-17 11:05 by 学员h26Tkc
[考研] 297求调剂 +4 学海漂泊 2026-03-13 4/200 2026-03-14 11:51 by 热情沙漠
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭