24小时热门版块排行榜    

查看: 2408  |  回复: 17
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

小科研女dow

木虫 (小有名气)

[求助] 构建基因文库的方法筛选到阳性克隆,克隆中插入的基因长为8000bp,如何找到目的基因? 已有3人参与

各位虫子们,大家好,小虫今天提出一个长久困扰的问题,希望得到大家的建议,先谢过了~
最近做基因文库,采用的PUC19作为载体,将不完全酶切的片段插入该载体中后,转化大肠杆菌DH5α,经过筛选得到阳性克隆,将阳性克隆单菌落培养提取质粒后送去测序公司测序,得到一个片段为8000bp的结果,以下为后续工作中遇到的问题:
1、目的基因应该不至于是8000bp这么大,小虫认为实际的目的片段式这8000bp中的一部分,经过软件划分ORF做了几个阅读框的表达,但是均无活性。
2、PUC19不是表达型质粒,所以没有办法将筛选的重组质粒直接转化到Rosetta和BL-21中大量表达,得不到目的蛋白。
3、曾经见过有人对PUC19做过改造,可以用于表达蛋白,而不是仅仅用来克隆,但是自己经验欠缺,没有这方面的基础。
4、还有人说,可以采用可以启动表达的宿主菌,也只是听说,并未接触过。

楼主主要的目的是在这8000bp中寻觅到真正的目的片段,请问有什么好的意见吗?先谢过了!
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

functional genomics

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

做出色的科研人
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

547star

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小科研女dow: 金币+10, ★★★很有帮助, 好的,谢谢~~~ 2014-09-01 19:21:29
改用其他内切酶(比如识别4个碱基的)来切,进一步缩小范围;或改用外切酶切,不同酶切时间取样把内切酶失活,亚克隆,缩小范围。分析ORF除了ATG外,再考虑下其他GTG等作为起始密码子的可能ORF。
为什么
11楼2014-09-01 00:29:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 小科研女dow 的主题更新
信息提示
请填处理意见