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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 引物二聚体是否影响SSR后续实验
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Insecta_A

铜虫 (小有名气)

[求助] 引物二聚体是否影响SSR后续实验已有4人参与

我的SSR-PCR跑出来的产物，有很明显的引物二聚体，有时比目的条带还要亮，请问SSR后续实验对引物二聚体要求严格吗？
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1楼2014-08-26 22:16:21
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Insecta_A

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by duanepp at 2014-08-31 09:10:54
二聚体多的话可以适当的减少引物的量，提高一下退火温度等操作减少。微卫星的pcr只要条件合适一般情况之下是很顺利的。你是做什么虫子的？...

我做的是双重PCR，单独跑的时候引物二聚体较少，我一直在优化，还是除不掉，所以我就想如果不影响后面的毛细管电泳的话，我就不打算再优化这个了
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8楼2014-08-31 15:10:40
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bwangel

银虫 (小有名气)

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★ ★
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Insecta_A: 金币+2, ★有帮助 2014-08-27 08:21:19
给个图，看看程度，不过比目标重很多总不太好了，有加高点温度不
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2楼2014-08-26 23:13:59
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Insecta_A

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by bwangel at 2014-08-26 23:13:59
给个图，看看程度，不过比目标重很多总不太好了，有加高点温度不

我正准备做个Touchdown PCR试试，温度升高过，但是得率太低了，所以就又降了点哦
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3楼2014-08-27 08:22:13
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duanepp

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
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Insecta_A: 金币+1, ★有帮助 2014-08-27 14:00:44
上图最好，还有如果你ssr的片段不是很小的话就没有大的影响。不过最好还是摸索出最适条件
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4楼2014-08-27 10:20:24
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