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lihuahan

银虫 (初入文坛)

[求助] 克隆时卡那筛选菌落 已有2人参与

各位大侠,最近在做表达载体的转化,转化后涂完含卡那霉素(终浓度50ug/ml)的板,37°培养12h后长了3个菌,想着有可能是培养时间不够,又放进去培养了3h,总共15h,长出很多小菌,那3个菌长得较大,就挑菌后(挑的中等大小菌落)又过夜摇菌,挑了20个总共只摇出来1个,但没摇出来的做了pcr验证后又有目的条带,这是什么原因尼?验证了抗生素没问题,感受态没问题,是因为卡那加的太多吗?急等~~~~~~
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xzy0425

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。 2014-07-29 11:57:56
不是因为卡那加多了,而是菌株生长缓慢。这一点可以从你的平板看出来,12小时只长了三个菌落,而15小时长了很多菌落。挑斑摇菌后,只摇出一个,而其他试管中PCR检测含有目的基因,说明也是含有菌落的,只是浓度太低看不清罢了,可以适当延长摇菌的时间。
受体菌与载体之间有亲缘性的关系,对载体进行改造后,会发生亲缘性的改变,亲缘性高,载体拷贝快,受体菌生长就快,反之亦然。我在实验中也遇到过这样的问题,就是通过适当延长时间来解决的,这个跟抗生素浓度无关。
2楼2014-07-29 10:05:17
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鬼羽帝魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
lihuahan(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-07-31 18:21:08
一般生长12-16h,再多了就只能挑大点的单克隆,小点的不要挑,时间太长抗生素可能失效了。
摇菌一般摇10h左右就能摇起来,没摇起来的要不就是放的不好或者是假的。
3楼2014-07-29 15:32:08
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lihuahan

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xzy0425 at 2014-07-29 10:05:17
不是因为卡那加多了,而是菌株生长缓慢。这一点可以从你的平板看出来,12小时只长了三个菌落,而15小时长了很多菌落。挑斑摇菌后,只摇出一个,而其他试管中PCR检测含有目的基因,说明也是含有菌落的,只是浓度太低 ...

我后期又做了一遍菌液pcr,结果都没p出来…摇菌摇出来的那管也没有额,都没转化进去吗?质粒加了200ng

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
4楼2014-07-29 17:30:57
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lihuahan

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 鬼羽帝魂 at 2014-07-29 15:32:08
一般生长12-16h,再多了就只能挑大点的单克隆,小点的不要挑,时间太长抗生素可能失效了。
摇菌一般摇10h左右就能摇起来,没摇起来的要不就是放的不好或者是假的。

我也觉得是有问题尼,菌大小差距还挺大,我的平板是4天前制好放在四度冰箱的,应该问题不大吧?

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
5楼2014-07-29 17:32:14
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xzy0425

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by lihuahan at 2014-07-29 17:30:57
我后期又做了一遍菌液pcr,结果都没p出来…摇菌摇出来的那管也没有额,都没转化进去吗?质粒加了200ng
...

那就先把摇菌要出来的那管做质粒回收并PCR验证,看看到底有没有目的基因,直接用菌液PCR效果稳定性方面感觉没有提质粒PCR好,你可以试试质粒PCR
6楼2014-07-29 21:37:00
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lihuahan

银虫 (初入文坛)

嗯嗯,好的,我再试试,谢谢啦~

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
7楼2014-07-30 15:58:36
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鬼羽帝魂

木虫 (著名写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by lihuahan at 2014-07-29 17:32:14
我也觉得是有问题尼,菌大小差距还挺大,我的平板是4天前制好放在四度冰箱的,应该问题不大吧?
...

平板没有问题,你挑大的摇
8楼2014-07-31 15:29:02
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