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hj5121428

铁虫 (初入文坛)

[求助] 求pkD4卡那霉素抗性基因kan的基因序列? 已有1人参与

求pkD4卡那霉素抗性基因kan的基因序列,想设计引物来着,可是在NCBI上不能确定序列是否正确,求好心人发个正确的pkD4卡那霉素抗性基因kan基因的序列,万分感谢啊!!!
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gyesang

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【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2013-12-10 14:57:43
是这段序列:at
gattgaacaa
gatggattgc
acgcaggttc
tccggccgct
501       
tgggtggaga
ggctattcgg
ctatgactgg
gcacaacaga
caatcggctg
551       
ctctgatgcc
gccgtgttcc
ggctgtcagc
gcaggggcgc
ccggttcttt
601       
ttgtcaagac
cgacctgtcc
ggtgccctga
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ggacgaggca
651       
gcgcggctat
cgtggctggc
cacgacgggc
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701       
cgacgttgtc
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751       
cggggcagga
tctcctgtca
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ctcctgccga
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801       
atcatggctg
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gcggctgcat
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851       
cccattcgac
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cgagcgagca
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901       
tggaagccgg
tcttgtcgat
caggatgatc
tggacgaaga
gcatcagggg
951       
ctcgcgccag
ccgaactgtt
cgccaggctc
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tgcccgacgg
1001       
cgaggatctc
gtcgtgaccc
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1051       
tggaaaatgg
ccgcttttct
ggattcatcg
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gctgggtgtg
1101       
gcggaccgct
atcaggacat
agcgttggct
acccgtgata
ttgctgaaga
1151       
gcttggcggc
gaatgggctg
accgcttcct
cgtgctttac
ggtatcgccg
1201       
ctcccgattc
gcagcgcatc
gccttctatc
gccttcttga
cgagttcttc
1251       
tga

出自:https://www.lablife.org/g?a=seqa ... 9c276ff89283fdc4_10
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
2楼2013-12-09 21:44:17
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hj5121428

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by gyesang at 2013-12-09 21:44:17
是这段序列:at
gattgaacaa
gatggattgc
acgcaggttc
tccggccgct
501       
tgggtggaga
ggctattcgg
ctatgactgg
gcacaacaga
caatcggctg
551       
ctctgatgcc
gccgtgttcc
ggctgtcagc
gcaggggcgc
ccggttcttt
601 ...

你确定是Kan基因的序列?
3楼2013-12-10 13:24:43
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

引用回帖:
3楼: Originally posted by hj5121428 at 2013-12-10 13:24:43
你确定是Kan基因的序列?...

是的
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
4楼2013-12-10 15:01:26
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hj5121428

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by gyesang at 2013-12-10 15:01:26
是的

怎么和我所看文献上设计的引物对不上啊???好奇怪啊?
5楼2013-12-10 18:48:10
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预防凯凯

新虫 (初入文坛)

哈哈,我找抗性基因,他娘居然,你也发了
6楼2014-04-07 22:14:55
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天宇201266

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by gyesang at 2013-12-09 21:44:17
是这段序列:at
gattgaacaa
gatggattgc
acgcaggttc
tccggccgct
501       
tgggtggaga
ggctattcgg
ctatgactgg
gcacaacaga
caatcggctg
551       
ctctgatgcc
gccgtgttcc
ggctgtcagc
gcaggggcgc
ccggttcttt
601 ...

你好,那你知不知道Kan基因两端的FRT基因序列
在路上。。。
7楼2015-04-02 10:03:02
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hj5121428

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 预防凯凯 at 2014-04-07 22:14:55
哈哈,我找抗性基因,他娘居然,你也发了

娶你妹的
8楼2015-04-02 15:30:22
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日光海

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

NCBI上这个是pKD4的全序列。http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/AY048743.1
在CDS上标注有/note="kanamycin resistance"。就是卡那抗性注释了。
我这边Red敲除的都有,但是菌本身抗氨苄,现在转向卡那抗性打靶,但是没有pKD4。楼主如果不麻烦,能寄我一份pKD4么?
周老湿
9楼2015-05-25 10:03:03
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