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意孤城_

金虫 (正式写手)

[求助] 想往一个载体中插入Kan抗性基因该怎么做

想往通过PCR方法向一个载体中插入一个Kan抗性基因(必须插入,因为要改造载体,不能选kan抗性原载体)。请问我PCR过程中除了要包含ATG开始编码Kan序列外,他的启动子和终止子序列该怎么寻找。NCBI上查了 没找到。有没有知道的 急求
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酶切专家

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+2, 鼓励应助 2013-04-01 22:31:30
意孤城_: 金币+1, ★★★很有帮助, 谢谢 2013-04-02 09:38:38
myprayer: 金币+2, MolEPI+1, 应助指数+1, 鼓励应助,分子生物版块,期待你的精彩。 2013-04-03 08:35:23
不知你准备从哪个载体上扩增(pET系列中好像有几个是ka抗性,可以参考)。
一般,原核的表达调控元件比较简单(启动子在atg上游100bp以内,终止子在TAG、TAA  or TGA下游100bp以内,启动子一般有表明显的-10区(TATAAT)和-35区结构,你可以自己找一找,而强终止子有明显的发夹结构,你可以试着找一找,如果嫌麻烦,可以直接扩增包含编码区上下游各100bp的序列,一般就足够了。
goodluck!
3楼2013-04-01 22:11:59
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普通回帖

意孤城_

金虫 (正式写手)

自己顶一个
2楼2013-04-01 16:27:51
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

你可以去查一个叫pEGFP-N1的载体,那个上面有Kana的抗性基因序列,包括启动子和终止子
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
4楼2013-04-02 20:31:07
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意孤城_

金虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by gyesang at 2013-04-02 20:31:07
你可以去查一个叫pEGFP-N1的载体,那个上面有Kana的抗性基因序列,包括启动子和终止子

你那有吗?能不能把他的启动子和终止子序列发给我啊  谢谢
5楼2013-04-02 20:37:55
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

引用回帖:
5楼: Originally posted by 意孤城_ at 2013-04-02 20:37:55
你那有吗?能不能把他的启动子和终止子序列发给我啊  谢谢...

你可以到网上去找,很好找的啊
具体启动子和终止子看质粒注释就可以了,然后你去要个这个载体,回来做PCR扩增就可以了
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
6楼2013-04-02 20:41:34
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酶切专家

金虫 (小有名气)


gyesang: 金币+1, 鼓励回帖应助! 2013-05-31 16:41:19
http://partsregistry.org/Promoters/Catalog/Ecoli/Constitutive

这个网站上有kat的启动子信息
7楼2013-04-02 22:44:55
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Haibara_Ai

铜虫 (小有名气)


gyesang: 金币+1, 鼓励回帖应助! 2013-05-31 16:41:27
不同来源的Kan启动子 codon不一样
随便找个常用质粒搜下注释就行了
8楼2013-04-03 01:03:21
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wt3532

木虫 (著名写手)

涛声依旧


gyesang: 金币+1, 鼓励回帖应助! 2013-05-31 16:41:36
随便找个质粒,在标示的卡那基因上,上下各300个碱基,肯定可以P出来的,在连接到你的质粒上就O了
9楼2013-04-03 11:39:44
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wt3532

木虫 (著名写手)

涛声依旧

我记的好像是之前看过专利,是抗生素抗性替换的,你找找看。中国专利
10楼2013-04-03 11:40:34
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