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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 关于平板菌落菌种鉴定的问题
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伊天_1990

铜虫 (初入文坛)

[求助] 关于平板菌落菌种鉴定的问题 已有4人参与

我做的是海参肠道菌群组成实验，取了2份样品，1份是传统培养基培养的方法，1份是分子生物学方法。传统方法培养后，需要鉴定培养基菌落的菌种，想送去测序，但是我该怎么把它们从培养基取出来？菌落不重复地取，目的降低测序成本。

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啦啦啦
1楼 2014-04-22 17:45:24
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xiaoamuchong

专家顾问 (职业作家)

科研工作者

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
设计培养基。先分离。再纯化。从培养基取出来的话是用接种环挑取。
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曾经有人问我为什么要学微生物，我只是想离生命的本质更近一点。
2楼2014-04-22 17:54:57
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伊天_1990

铜虫 (初入文坛)
问题是12个平板不能都挑取，有重复的菌落.主要是怎么选择？而且要有代表性。

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啦啦啦
3楼2014-04-22 20:44:53
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伊天_1990

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by xiaoamuchong at 2014-04-22 17:54:57
设计培养基。先分离。再纯化。从培养基取出来的话是用接种环挑取。

问题是12个平板不能都挑取，有重复的菌落.主要是怎么选择？而且要有代表性。

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啦啦啦
4楼2014-04-22 20:46:00
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well_想太多

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
既然是菌群肯定是要先分离纯化的，得到单菌落，可以从外观观察区分不同的菌种，然后挑取单菌落pcr，，你说的不重复鉴定的话，可以先用显微镜区分一下
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5楼2014-04-22 23:00:14
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xiaoamuchong

专家顾问 (职业作家)

科研工作者

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
伊天_1990: 金币+5, ★★★很有帮助, 谢谢，已经解决了。 2014-04-24 14:06:35
引用回帖:
4楼: Originally posted by 伊天_1990 at 2014-04-22 20:46:00
问题是12个平板不能都挑取，有重复的菌落.主要是怎么选择？而且要有代表性。
...

原来是这样。主要有弧菌、假单胞菌、（节、棒状、不动、黄、柄）杆菌、放线菌、微球菌、奈瑟菌这么几种。其中弧菌属、假单胞菌属占大多数。希望可以帮到你。
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曾经有人问我为什么要学微生物，我只是想离生命的本质更近一点。
6楼2014-04-22 23:09:40
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quiller2000

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
首先，既然你已经做了分子鉴定，那么鉴定纯培养意义就不大了

其次，如果你是要筛选特定功能的微生物，那么根据你的筛选模型来搞！

最后，如果你真要这么搞，为了降低测序成本，你把每个菌都挑出来，做16S rDNA-RFLP,根据分型的结果分组，然后每组送一个去测序
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致良知
7楼2014-04-22 23:38:32
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伊天_1990

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
7楼: Originally posted by quiller2000 at 2014-04-22 23:38:32
首先，既然你已经做了分子鉴定，那么鉴定纯培养意义就不大了

其次，如果你是要筛选特定功能的微生物，那么根据你的筛选模型来搞！

最后，如果你真要这么搞，为了降低测序成本，你把每个菌都挑出来，做16S rDN ...

主要还是从平板上取的问题，因为平板上菌落数10-1000不等，面对12个平板，有的板子菌落少，形态大比较好区分，可以挑取不同菌落，但有的菌落数目大，形态基本单一，差异不明显，不好选择挑取，而且前面挑取的后面在挑取的话还想着尽量不要重复（重复多了，增加测序成本）。

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啦啦啦
8楼2014-04-23 07:29:45
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思恋是一种病

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
除了根据你的试验目的，设计好筛选培养基，筛选模型，先去掉一部分。好象没有好办法

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9楼2014-04-23 09:48:51
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