应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 奇怪测序结果
121/2返回列表12下一页
查看: 1003  |  回复: 11
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

wangtailin

银虫 (小有名气)

[求助] 奇怪测序结果 已有2人参与

同一基因，同一引物，匹出两条带，放入pEASY 载体，筛选阳性后送测序，结果为啥差异这么大呢，求大师解答？

奇怪测序结果
测序比对.png
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
学习着提升自己
1楼 2014-07-26 16:00:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangtailin

银虫 (小有名气)
应该是完全比对的上啊，测序应该不出错，很奇怪的问题，后面一部分也是对不上，咋回事呢？
奇怪测序结果-1
比对.png
赞一下 回复此楼
学习着提升自己
2楼2014-07-26 17:09:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

luwei13566

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-07-26 19:18:04
你用于比对的这两条序列是啥~？你不是根据已知基因设计引物扩增出来大小不同的两条序列吗？那这两条序列和你的已知基因序列的比对结果如何，你上面的应该是你两条测序结果间的比对吧，关键看和已知基因的比对结果。你做个多序列比对看看。
赞一下 回复此楼
大家相互帮助哈
3楼2014-07-26 17:18:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangtailin

银虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by luwei13566 at 2014-07-26 17:18:52
你用于比对的这两条序列是啥~？你不是根据已知基因设计引物扩增出来大小不同的两条序列吗？那这两条序列和你的已知基因序列的比对结果如何，你上面的应该是你两条测序结果间的比对吧，关键看和已知基因的比对结果。 ...

我做的是RACE，和已知比对只有一条和原来的比对成功，另一条不行，比对不上；但是两条测序结果却又很大的重复！
赞一下 回复此楼
学习着提升自己
4楼2014-07-26 21:05:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

luwei13566

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
wangtailin: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-07-27 21:23:48
引用回帖:
4楼: Originally posted by wangtailin at 2014-07-26 21:05:12
我做的是RACE，和已知比对只有一条和原来的比对成功，另一条不行，比对不上；但是两条测序结果却又很大的重复！...

你的意思是用你的这个软件来比对，一条片段测序结果和目的基因是一致的，另一条片段和已知片段比较相似度很低，但是把两条测序序列放一块又有不少重复序列对吧~？建议你用NCBI的blast再两两比对或者直接来个多重比对试一下。我估计你的第二个比对的比对方法不对。
赞一下 回复此楼
大家相互帮助哈
5楼2014-07-26 21:52:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangtailin

银虫 (小有名气)
内容已删除
赞一下 回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : 847-5R.fas
    • 2014-07-27 10:14:25, 3.08 K
学习着提升自己
6楼2014-07-27 10:14:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangtailin

银虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by luwei13566 at 2014-07-26 21:52:13
你的意思是用你的这个软件来比对，一条片段测序结果和目的基因是一致的，另一条片段和已知片段比较相似度很低，但是把两条测序序列放一块又有不少重复序列对吧~？建议你用NCBI的blast再两两比对或者直接来个多重比 ...

>847-5cexu
GCGGTACTCTATAGGGCGATTGAGCTGCCCTTAAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTACATGGGGACAGACGTCGAACTCTC
ACTGGACTGCAAGCCATTCAGTTCACCCGGCCTGACTAGCGAGCAGCGAGCTGTGATTGTCCCGACCGCTTCATTGTACT
ACCGAGTATTGATTGATTAATTACATCAGCTAGCTAGCGAGATGGCGCCACCAACGGACCAATTCGCTTCAGCTCCCAAC
CCCAACAGCCTGTGGACAGAAACTGATCAGGCCAAGTATCACGAGGCCCCGGCGGACCCATCTCGTAGCTGCGTTTTGGG
CCTGGGCACCGCCAACCCTGAGACAGGACTCAGCATGGAAGACTTCGGAAACATGATCCTCGATATCTACGGGTATCAAG
ACGTGCCGCTGGCGAAATCGTTTGTGGAACGTGTCGCCAAGGCGTCAGGGATTAAGAAGAAGCAAGTGGTGGCGTCGTAC
CAGGTGTACAAGGACAATCCCTGTCTGCAGGGATTCAATGAGTCCAACCTGGGAGAGAGGTTCCGAATCTACGAGCCGGC
GACCATGGAGACGGGCCAGCTCGCGGCCGAGAGGGCGCTGAGCGACTGGGGCGGCGACCGCGACGACATCACGCATCTCA
TCACGTACTCCACGTCCATGCTGCTGTCGCCGTCGCTGGACCTGCGTCTGCTGCGCGTCCTGAACCTCAAGCCCACCGTG
AAGCACTTCAGCGTTTCGCTCCTGGGCTGCCACGGCGGCGTGAACGGGATCCGGACCGCGGCGGAGATCGCCCAGGCCGA
CCCCAACAACCGGGTCCTGGCGGTGTTCGTGGAGATCAATTCCGTGGCGGCCCAGTCCCTGAACCCAGCGAATCCGAAGG
GCAGCTTGGCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACCACAACATACGA
GCCGGAAGCATAAAGTGGTAAAGGCCTGGGGGTGCCTATGGAGTGGAGCTAACTCAACATTAATTGGCGTTGCGGCTCAC
TGCCCGCTTTCAGTCGGGAAACCTGTCTGCCAGCTGCATATGATCGCACGCGCGGGGAGAGGCGATCGCCGTATGGGCGC
TCTCGCTCCTCGCTCACGACTCTTCGCTCGGGCGTTCGCTTGCGTGCGAGCGTTTCAGCCTCACTTCAAGGCGTATACCG
TATCCAGGATCCGGATTACGCCAGGTAG
>847-5cexu
AACGCCAACTATATAGGGCGATTGAGCTGCCCTTAAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTACATGGGGACAGACGTCGAACTC
TCACTGGACTGCAAGCCATTCAGTTCACCCGGCCTGACTAGCGAGCAGCGAGCTGTGATTGTCCCGACCGCTTCATTGTA
CTACCGTAAGACCCGCTGCAGTTAGTCCTGTGAAAACGCCAGTCTTTTCTCTCTCTTCAATTCAAACCTTGAATGTTTAT
TAGCGCCTTCAGGTGACATAAATTGCTGGTCACTCTCAGGACATGCTACAGGCAATTCATGACATTGTCGGACTCGTCTA
GCGGATGCTTACAGTATTAAACCCGAGGCTCAGGTCTATCTGCGAGCTGTAGTGATCACACAAGTTCCGGAGATCTCTCC
ATATATCGTTCAGACGCCGACTCCCATATATTCAACCTGGTAGCTCAGGAGTATTGATTGATTAATTACATCAGCTAGCT
AGCGAGATGGCGCCACCAACGGACCAATTCGCTTCAGCTCCCAACCCCAACAGCCTGTGGACAGAAACTGATCAGGCCAA
GTATCACGAGGCCCCGGCGGACCCATCTCGTAGCTGCGTTTTGGGCCTGGGCACCGCCAACCCCGAGACAGGACTCAGCA
TGGAAGACTTCGGAAACATGATCCTCGATATCTACGGGTATCAAGACGTGCCGCTGGCGAAATCGTTTGTGGAACGTGTC
GCCAGGCGTCAGGGATTAAGAAGAAGCAAGTGGTGGCGTCGTACCAGGTGTACAAGGACAATCCCTGTCTGCAGGGATTC
AATGAGTCCAACCTGGGAGAGAGGTTCCGAATCTACGAGCCGGCGACCATGGAGACGGGCCAGCTCGCGGCCGAGAGGGC
GCTGAGCGACTGGGGCGGCGACCGCGACGACATCACGCATCTCATCACGTACTCCACGTCCATGCTGCTGTCGCCGTCAC
TGGACCTGCGTCTGCTGCGCGTCCTGAACTCAAGCCCACGTGAGCACTCAGCGTTTCGCTCCTGGGCTGCACGCGGCTGG
ACGGGATCGGACCGCGTGCGAAATCGCAGCGACCACCACAGCAACGGTCTGCGTGTTCGTGGAGAATCAATCATGGCGTC
GACTGACCTGCGATCGACGGCACTTGGCGATACATGCCATAGCTGTTCCTGTGTGAACTTGTTTAT
>847-5yizhi
ACGGCGGGTGAACGGGATCCGGACCGCGGCGGAGGATCGCCAGGCCGACCCCAACAACCGGGTCCTGGCGGTGTTCGTGGAGATCAATTCCGTGGCGGCCCAGACCCTGAACCCAGCGAATCCGTCTGCGGACTTGAGCCCGTTTCTAGTCAACATGTTATTTGGGGATGGATCGGGCGCCGTGGTGGTAGGCAAGCACCCCACGAAGAAGGAGACCAGCATCCTTGAGGTCCACCGGTCGCAGACATACCTGATTCCGGACTCCAGCACGAGCATCGGCGCCATCTTGCTGGAATCCGGGATGCACACCACTCTGGAGAAGAATGTGCCTCTGCATGTGGCGCAACATGTGGGCGGCTTCGTCACGGAGCTTCTGCACAACACCAAGCTCAGCTTCGCCAACGTCAACTGGGCTTGCCATCCCGGAGGCAAGGGCATCCTCGACGCTGTCGAGAAGAGTTGCAAGCTCAAACCTGAGCAGCTCCAATCGTCCAGACACATTTTGGGTAACTATGGGAACATGGGGGCCACGACTGTATTGTTTGTGCTTGACAAGTTACGCCGTGATAAGAAAGTGGATTCTACCATCCACCCTTGGACAACGGCTCTGTCATTTGGGCCCGGGATCACCGTGGAGGGGCTGCTC
赞一下 回复此楼
学习着提升自己
7楼2014-07-27 10:15:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

forrestgump

新虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
wangtailin: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-07-27 21:22:39
可能是可变剪切体，也有可能是有碱基缺失或插入致使的，能上传您的测序峰图文件吗？这样我就可以断定了。
赞一下 回复此楼
8楼2014-07-27 20:09:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

luwei13566

木虫 (正式写手)
1.你的前两个测序结果没有去除载体序列吧，你载体上连了多大的片段？
2.第三段序列是你的目的序列吗？
赞一下 回复此楼
大家相互帮助哈
9楼2014-07-27 20:21:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangtailin

银虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by forrestgump at 2014-07-27 20:09:50
可能是可变剪切体，也有可能是有碱基缺失或插入致使的，能上传您的测序峰图文件吗？这样我就可以断定了。

听候学长讲解，
下面是已知的，用的是pfu酶，为啥有如此差异呢，不懂啊
>847-5yizhi
ACGGCGGGTGAACGGGATCCGGACCGCGGCGGAGGATCGCCAGGCCGACCCCAACAACCGGGTCCTGGCGGTGTTCGTGGAGATCAATTCCGTGGCGGCCCAGACCCTGAACCCAGCGAATCCGTCTGCGGACTTGAGCCCGTTTCTAGTCAACATGTTATTTGGGGATGGATCGGGCGCCGTGGTGGTAGGCAAGCACCCCACGAAGAAGGAGACCAGCATCCTTGAGGTCCACCGGTCGCAGACATACCTGATTCCGGACTCCAGCACGAGCATCGGCGCCATCTTGCTGGAATCCGGGATGCACACCACTCTGGAGAAGAATGTGCCTCTGCATGTGGCGCAACATGTGGGCGGCTTCGTCACGGAGCTTCTGCACAACACCAAGCTCAGCTTCGCCAACGTCAACTGGGCTTGCCATCCCGGAGGCAAGGGCATCCTCGACGCTGTCGAGAAGAGTTGCAAGCTCAAACCTGAGCAGCTCCAATCGTCCAGACACATTTTGGGTAACTATGGGAACATGGGGGCCACGACTGTATTGTTTGTGCTTGACAAGTTACGCCGTGATAAGAAAGTGGATTCTACCATCCACCCTTGGACAACGGCTCTGTCATTTGGGCCCGGGATCACCGTGGAGGGGCTGCTC
赞一下 回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : 84759-5R测序结果.zip
    • 2014-07-27 21:12:06, 373.82 K
学习着提升自己
10楼2014-07-27 21:15:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 wangtailin 的主题更新
121/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 申博/考博 +4 啃面包的小书虫 2026-04-17 8/400 2026-04-21 16:26 by 啃面包的小书虫
[考研] 295分求调剂 +6 ?要上岸? 2026-04-17 6/300 2026-04-21 08:18 by Equinoxhua
[考研] 085600材料与化工调剂 5+3 孜孜不倦2002 2026-04-19 6/300 2026-04-20 21:25 by babero
[论文投稿] 期刊推荐 +3 材料研究生 2026-04-15 5/250 2026-04-20 16:02 by 豆豆7758
[论文投稿] 有没有接收比较快的sci期刊呀，最好在一个月之内的，研三孩子求毕业 20+4 之护着 2026-04-16 7/350 2026-04-20 15:45 by 豆豆7758
[教师之家] 又一批高校组建人工智能学院 师资行吗 不是骗人吗 +4 yexuqing 2026-04-19 4/200 2026-04-20 14:47 by brantleo
[考研] 337求调剂 +3 jyz04 2026-04-18 3/150 2026-04-20 12:24 by 研可安
[考博] 申博 +3 Xyyx. 2026-04-18 3/150 2026-04-20 10:44 by YuY66
[考博] 湖南大学刘巧玲课题组2026年第二批次博士研究生招生信息 +3 南风观火 2026-04-18 5/250 2026-04-20 10:13 by 南风观火
[考研] 求计算机方向调剂 +3 Toffee2 2026-04-16 6/300 2026-04-19 22:37 by ll叶
[考研] 307中医考研调剂 +9 于以采蘩 2026-04-14 9/450 2026-04-19 08:41 by 烟雨流涯
[考研] 294求调剂 +15 淡然654321 2026-04-15 15/750 2026-04-19 08:20 by cuisz
[考研] 0854求调剂 +23 门路摸摸 2026-04-15 27/1350 2026-04-19 01:59 by 烟雨流涯
[考研] 接受任何调剂 +6 也就是栗子 2026-04-17 7/350 2026-04-18 17:20 by 涵竹刘
[考研] 收到复试调剂但是去不了 +8 小蜗牛* 2026-04-16 8/400 2026-04-18 11:15 by zixin2025
[考研] 260求调剂 +4 Zyt1314520.. 2026-04-17 5/250 2026-04-18 08:28 by babysonlkd
[考研] 急需调剂 +9 绝不放弃22 2026-04-15 10/500 2026-04-18 08:09 by chixmc
[有机交流] 二苯甲酮酸类衍生物 50+3 小白爱主人 2026-04-17 6/300 2026-04-17 18:47 by kf2781974
[考研] 322求调剂 +6 tekuzu 2026-04-17 6/300 2026-04-17 13:48 by Espannnnnol
[考研] 一志愿沪9，生物学326求调剂 +9 刘墨墨 2026-04-15 9/450 2026-04-16 17:14 by 崔崔崔cccc
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭