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pei小f

新虫 (初入文坛)

[求助] 初学gromacs，关于力场选择和残基出错问题的请教。

在VMD中对金属氧化物NiO进行了粗粒化，生成了pdb文件，然后想用gromacs中pdb2gmx命令将其转化为gro，但是提示错误如下：
Residue 'NiO' not found in residue topology database
我这个问题不是一般的生物大分子，比较特殊，该怎么解决？
还有，由于初学，对力场并不十分了解，所以该如何选择适合我的问题的力场呢？
求大神指教！！！！
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1楼 2014-07-02 08:52:06
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小许高年级

新虫 (初入文坛)
请问同学最后您解决了吗？ 我现在也遇到这样的问题， 如果您解决了的话，请告知。

发自小木虫IOS客户端
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MD小白
2楼2020-06-23 14:39:51
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