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chongyangwin木虫 (正式写手)
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请问,怎么样生成oplsaa力场的top文件?已有1人参与
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有一个新做的氨基酸或者小分子,想生成oplsaa力场的top文件,不知道有哪些软件工具可以用?? 因为我跑Gromacs用的是oplsaa全原子力场,试了一些软件,topolbuild,topolgen,MKTOP, 但是都出现这样那样的错误导致无法正确生成TOP文件。用oplsaa力场好悲催啊,不像Gromos力场,prodrg好强大,直接把itp,gro等等都生成出来了,兼容性也大。但是,我还是想跑oplsaa力场,oplsaa力场跑出来的更加精细,请求大侠帮助啊??能给个生成oplsaa力场的top文件的工具吗?? |
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zhangmao511
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2楼2014-05-21 23:51:38
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