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pei小f

新虫 (初入文坛)

[求助] 初学gromacs,关于力场选择和残基出错问题的请教。

在VMD中对金属氧化物NiO进行了粗粒化,生成了pdb文件,然后想用gromacs中pdb2gmx命令将其转化为gro,但是提示错误如下:
Residue 'NiO' not found in residue topology database
我这个问题不是一般的生物大分子,比较特殊,该怎么解决?
还有,由于初学,对力场并不十分了解,所以该如何选择适合我的问题的力场呢?
求大神指教!!!!
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小许高年级

新虫 (初入文坛)

请问同学最后您解决了吗? 我现在也遇到这样的问题, 如果您解决了的话,请告知。

发自小木虫IOS客户端
MD小白
2楼2020-06-23 14:39:51
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