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SOS!测序结果比对问题
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SOS!测序结果比对问题
美吉测序后,在NCBI上进行比对,如下图,query是试验测序结果,sbjct是NCBI中的,query从35到99,而sbjct从72到7,这样序列排列能对应上,作发育树时,在clustalx做complete alignment后,序列完全对不上,原因可能是,query顺序还是从35到99,但是sbjct对应的序列从小到大排列,不知道是这原因吗?如何解决?建树时要确保所选序列都为正义链或反义链吗?
屏幕快照 2014-06-25 上午10.49.42.png
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