应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 求问 关于测序深度的问题
61/1返回列表
查看: 2058  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

18aixiaoxi

银虫 (初入文坛)

[求助] 求问 关于测序深度的问题 已有1人参与

做了定量PCR和454高通量测序
现在得到测序的coverage指数在80%-90%左右
这样可以写到文章里面去么。

请问一下指数大概在多少可以证明这次测序是合理的呢~！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
一只自言自语被偷走的心~
1楼 2014-02-16 10:26:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

csumaliyuan

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
18aixiaoxi: 金币+1, ★★★很有帮助 2014-02-16 12:10:05
laozuzunzhe: 金币+1, 鼓励应助！ 2014-02-16 21:44:41
18aixiaoxi: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2014-02-17 10:48:01
覆盖度和深度都要考虑，80-90%可能有点低了。

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
2楼2014-02-16 11:56:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

18aixiaoxi

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by csumaliyuan at 2014-02-16 11:56:08
覆盖度和深度都要考虑，80-90%可能有点低了。

因为做了3个相似水平，90%95%还有97%。
97%在80%  其他都在90%左右。
那如果不把coverage指数写上去，只写出ace shannon这些指数的计算结果。会不会对文章有影响呢？

谢谢您的回答。
赞一下 回复此楼
一只自言自语被偷走的心~
3楼2014-02-16 12:09:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

muji9908

铁虫 (小有名气)
请问你测的是什么？单一菌株，还是环境宏基因组？
赞一下 回复此楼
4楼2014-02-18 09:09:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

18aixiaoxi

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by muji9908 at 2014-02-18 09:09:15
请问你测的是什么？单一菌株，还是环境宏基因组？

是污泥的微生物总量。
赞一下 回复此楼
一只自言自语被偷走的心~
5楼2014-02-18 10:22:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

一苇饭

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 18aixiaoxi at 2014-02-16 12:09:46
因为做了3个相似水平，90%95%还有97%。
97%在80%  其他都在90%左右。
那如果不把coverage指数写上去，只写出ace shannon这些指数的计算结果。会不会对文章有影响呢？

谢谢您的回答。...

楼主，请问问题解决了没有？指数多大才能说明测序数据合理呢？
赞一下 回复此楼
6楼2015-09-17 16:27:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 18aixiaoxi 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭