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一桶稀泥

木虫 (正式写手)

[求助] 克隆基因,总是少28bp 已有7人参与

大家好,我克隆一个全长513bp的基因,连完载体菌液送测序总是少28bp,后来送PCR产物,发现也是少28bp,从条带上来看也看不出来,跑胶没有不特异的条带,有附图;最后一张附图是我截取的基因序列前面一部分,划线部分是缺失的28bp,另外缺失序列后面紧接着的28bp只有一个碱基不同,会不会测序有什么影响,另外缺失的碱基数不是3的倍数,很奇怪?谢谢大侠们了

克隆基因,总是少28bp
PCR全长.jpg


克隆基因,总是少28bp-1
酶切(ECOR1).jpg


克隆基因,总是少28bp-2
基因部分序列.jpg
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木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
一桶稀泥(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励热心回帖交流 2014-05-29 13:11:14
多下载几个序列分析看看,确认下是不是正常都有这28bp的2个重复序列。然后再判断其他的。实在需要得到有重复序列的基因,省事的话就是委托合成,自己做的话就参考18楼的在重复序列两端分别设计加入BsaI之类内切酶的引物,扩增上下游2个都带了重复序列的片段,再酶切连接得到目的序列。
为什么
21楼2014-05-28 18:53:57
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