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成功源于想像

铜虫 (小有名气)

[求助] 粘性末端连接时长问题 已有5人参与

小弟最近在做载体构建,情况如下:
1)载体pGL3,MluI/BglII两酶切,大小为4818bp;
2)片段:BssHII/BamHI双酶切,大小为4923bp;
3)连接摩尔比为:载体/片段=1/4;
4)T4连接10分钟(25度)。

结果:挑了六个克隆全为假阳性。
想请教的问题如下:
1)如果连接成功,片段大小近10K,这么大的片段转化(热激法)是不是有难度?
2)一般来说热激法42度多少秒比较合适?
3)载体和片段都是粘性末端,所以按照说明书操作,T4连接仅用了10分钟(25度),时间是不是短了?
4)这个摩尔比是否合适?
5)挑克隆时按如下操作不知可否:挑克隆于10ul蒸馏水中,混匀取1ul做PCR模板,PCR结果若为阳性,把剩下的9ul用于扩培,不知道这个菌落置于蒸馏水中能存活多长时间?

目前自己想尝试以下两个方法:
1)继续挑克隆,说不定能挑到阳性的。
2)16度连接过夜试试。
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meng_xu

铜虫 (小有名气)

★ ★
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-05-24 17:54:57
1. 没有问题,20k的我也转过
2. 个人一般做60s
3. 我一般做连接是22度30分钟,20ul体系,1ul NEB T4(低浓度的),最近做的几个4+6kb的连接,都没有问题,如果你用的是超高浓度的,10分钟应该够了
4. 这个比例其实很让人纠结,反正我一般都是V:I=1:3吧
5. 可以在平板上标记记号,回头去平板拿不是很方便?另外,取菌落也不用全取,点一点点儿就够了啊
9楼2014-05-23 06:16:10
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meng_xu

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
15楼: Originally posted by 成功源于想像 at 2014-05-24 12:13:19
“1. 没有问题,20k的我也转过”
之前做了二个6+2K的,很顺利,阳性率接近100%,这次10k, 我以为算大的了呢~

“2. 个人一般做60s”
你做的时候,用的什么管子呢?据说这个管子的厚薄对转化是有影响的,管子薄 ...

就是普通的1.5ml管,我用水浴,没什么问题。

对于连接的转化,如果要是室温连接,那么你的感受态最好效率高些。

平板上标记不是很常用的操作么?你挑选克隆的时候,圈上,标记,然后回头找的时候知道哪个菌落对应哪个菌液。
21楼2014-05-25 02:39:45
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