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nbzhenzhen

新虫 (初入文坛)

[求助] 大肠杆菌培养 质粒提取后困惑已有8人参与

最近老师要求做   实时荧光定量PCR的细菌16S rRNA基因全长的标品。老师说,用质粒克隆的方法制备这样的标品。具体操作如下:
1.JM109 16s RNA基因全长的扩增(27f-1492r)
2.切胶纯化回收
3.目的基因与载体(PMD 19-T vector)的连接:10ul,4℃,过夜。
4.将连接有目的基因的载体转化至感受态细胞 DH5α:50ul感受态细胞与10ul以上溶液(第3步的)混合,冰上30min,42℃ 45s,冰上1min,加440ul SOC培养基37℃,180rpm,培养1h。
5.涂布:配制LB培养基,灭菌稍冷却后,添加1/1000的Amp,倒平板制成固体培养基。混合30ul x-gal、7ul IPTG和63ul ddH2O,加至固体平板上,涂布均匀。
             取10u l第4步培养液,混合90ul灭菌dd H2O,相当于稀释10倍后,加至固体平板上,涂布均匀。
6.培养:倒置平板,待平板上的冷凝水晾干后,置于37℃,静置培养过夜。
7.蓝白斑筛选,培养:取出培养基,挑取白斑至3-4ml LB液体培养基(灭菌冷却后加1/1000Amp)中,37℃,180rpm,几个小时后,转移至100ml LB液体培养基中(灭菌冷却后加1/1000Amp)。37℃,180rpm,16h。
8.质粒提取:取第7步培养后的菌液5ml,离心,弃上清。步骤按照TIANGEN质粒提取试剂盒。
问题就卡在了质粒提取后,出现3个条带,如图跑得最快的两条最亮。问过同实验室的师兄师姐,他们说未遇到过这种情况,他们提出来的质粒都是两条,一条是不亮的基因组DNA,一条是亮的质粒。我不知道我的是怎么回事,质粒提取操作重复两次,仍是一样的结果。求解。

大肠杆菌培养  质粒提取后困惑
E.coli 质粒的提取.png
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lihe131

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-05-15 13:25:06
质粒分为超螺旋、缺刻和线性的,表观迁移率不同。你查查生化书吧,写得很清楚的。
2楼2014-04-15 15:02:54
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Neo2000

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
很正常,没必要纠结

[ 发自小木虫客户端 ]
3楼2014-04-15 17:23:43
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不爱做实验

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
nbzhenzhen(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-04-16 19:25:04
这是正常现象,你确定你问的那些人说不知道?!据了解,其实远不止3条带,
但是,一般情况下,看到两条活着三个是没问题的。。。
如果感兴趣,你可以查一下关于质粒的具体介绍。。。
4楼2014-04-15 18:42:47
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nbzhenzhen

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 不爱做实验 at 2014-04-15 18:42:47
这是正常现象,你确定你问的那些人说不知道?!据了解,其实远不止3条带,
但是,一般情况下,看到两条活着三个是没问题的。。。
如果感兴趣,你可以查一下关于质粒的具体介绍。。。

质粒的3种形态我知道,那我若需要这个样品做荧光定量PCR的标品,该怎么进行下一步呢?
5楼2014-04-16 09:40:42
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不爱做实验

银虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by nbzhenzhen at 2014-04-16 09:40:42
质粒的3种形态我知道,那我若需要这个样品做荧光定量PCR的标品,该怎么进行下一步呢?...

这个我就不是很了解了,没有什么建议了。。。
6楼2014-04-16 09:47:54
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mada1986

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-05-15 13:25:19
应该没问题,实在不放心可以拿质粒去测个序
7楼2014-04-16 13:15:18
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zhuzhicheng

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-05-15 13:25:16
质粒3条带很正常,没必要纠结,如果不放心就去测序,序列对了就行了啊  质粒定量稀释成标准品不就得了
8楼2014-05-15 10:32:52
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残剑流霜

木虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

挺漂亮的质粒提取啊……没问题的
9楼2014-05-19 15:12:28
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wakasasa

银虫 (小有名气)

亲,你做RNA,提质粒干嘛?
445566
10楼2014-06-12 09:45:45
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