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请教——质粒双酶切问题 已有4人参与
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我的目的是想把片段C插入载体A(A长度4.2Kb)中,酶切位点是 xbaI 和 xhoI 我是这样做的: 先把另一个已经构建好了的片段B(900bp左右)插入A的质粒(插入的时候也是用xbaI 和 xhoI)双酶切 切下片段跑胶验证了,一个4.2Kb左右,一个900bp左右,我把4.2kb的条带A切下回收 用回收后的A与C连接转化,A与水作为自连对照 现在的问题是自连对照(100多个克隆)长的菌比连接的(50个克隆左右)都多,还有无意义去验证连接成功否? 另外,既然双酶切切开了,大小条带都对,为什么自连对照会有那么多克隆呢? |
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3楼2014-03-28 18:05:45
【答案】应助回帖
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建议你进行验证,做个PCR test。 载体的自连不一定是在试管里发生的 线性的DNA也可以进行转化(单酶切后的质粒直接转化细菌也是可以长点的,效率稍微低一点而已) 线性化的质粒进入细胞后,虽然是粘末端,也可以被细菌的DNA酶平齐化,之后再连接。 至于为什么载体自连比加入了片段的还多,这个不好解释。 但是,关键在于,加入了片段后的结果和未加片段的结果不一样了(100 vs. 50),这一点就是继续进行检测的理由。 如果你觉得理由不充分的话,可以优化一下载体和片段的比例,一般来说,减少片段的用量会好一些(因为大部分的情况是载体浓了) |
2楼2014-03-28 17:51:33
鬼羽帝魂
木虫 (著名写手)
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4楼2014-03-28 19:03:06
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