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摩羯的心

铁虫 (小有名气)

[求助] 电泳图中出现的杂带是什么原因 已有8人参与

各位虫友,帮我分析一下电泳图中出现杂带的原因吧  下面大约186bp大小的条带是我的目的条带,上面两条比较暗的是杂带,我是直接用PCR产物没有纯化,稀释后直接当作下一步PCR的模板,之前退火温度55度也是出现这种情况,我把退火温度调成58度后还是有杂带,25ul的体系我taq酶用量是0.3ul,模板的用量大约在80ng左右,大家帮忙分析一下出现这种现象的原因吧  谢谢啦!

电泳图中出现的杂带是什么原因
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摩羯的心

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 晶晶梁 at 2014-03-14 12:26:38
引物不是特别好的话,PCR产物容易出现非特异性条带,可能第一次PCR不明显,但是用PCR产物当模板后扩增出来就很明显了,我之前也出现过这样的情况。

那你是怎么处理的呢 我打算将PCR产物纯化后再进行第二步PCR
5楼2014-03-15 20:31:08
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njuzhangxin

铁杆木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
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摩羯的心(kx444555代发): 金币+2, 鼓励交流 2014-03-14 09:22:33
摩羯的心: 金币+1 2014-03-14 09:32:18
引物特异性并不是太好,与模板有非特异性结合,如果追求单一带,重新设计引物。
2楼2014-03-14 09:11:44
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dongguolang

新虫 (小有名气)


【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-03-14 13:24:57
提高退火温度,或者切角回收,把目的条带切出来,
3楼2014-03-14 10:56:55
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晶晶梁

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
摩羯的心(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-03-14 13:24:47
引物不是特别好的话,PCR产物容易出现非特异性条带,可能第一次PCR不明显,但是用PCR产物当模板后扩增出来就很明显了,我之前也出现过这样的情况。
4楼2014-03-14 12:26:38
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