24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 1469  |  回复: 3

小孽博士

新虫 (小有名气)

[求助] 半定量PCR内参 已有2人参与

做半定量PCR,提RNA反转录成cDNA后扩actin,带非常亮。扩目的基因带时有两条带,经比对后鉴定大的那条是基因组带,小的那条是cDNA带,大小吻合,说明提RNA过程中有DNA未消化干净,cDNA中混有DNA污染。鉴于样本比较多,重新提RNA较麻烦,想了一个办法,请各位虫友帮忙看是否可行。本实验室所用内参为actin2,想在设计actin引物时设计两条跨内含子的引物,j基因组带比cDNA带要长将近200bp, 这样扩actin 的时候就会有两条带,一条基因组带,一条cDNA带。然后我只将cDNA带的亮度调一致,可以认为这就是总cDNA的内参吗?大家觉得可以吗?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

千磨万击还坚劲,任尔东西南北风
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lvbobo823

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小孽博士: 金币+5, 有帮助 2014-02-19 20:16:23
我觉得可以,引物肯定是过量的,但有时会不会出现特殊结构使引物更倾向于结合gDNA而导致cDNA扩增量不足。
hehe
2楼2014-01-13 21:51:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小孽博士

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lvbobo823 at 2014-01-13 21:51:02
我觉得可以,引物肯定是过量的,但有时会不会出现特殊结构使引物更倾向于结合gDNA而导致cDNA扩增量不足。

我师兄也是这样说,怕有DNA污染或影响cDNA扩增,刚合了引物,做一下试试看吧,谢谢~
千磨万击还坚劲,任尔东西南北风
3楼2014-01-13 22:36:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小孽博士: 金币+5, 有帮助 2014-02-19 20:16:09
不建议这么做。因为当有不同模板竞争引物时,扩增效率可能会降低,会影响定量结果。你可以把为消化干净gDNAd的RNA重新消化,再做反转录。
4楼2014-01-13 23:58:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 小孽博士 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 22408 312求调剂 +24 门路摸摸 2026-04-14 26/1300 2026-04-18 13:04 by wunaiy88
[考研] 260求调剂 +4 Zyt1314520.. 2026-04-17 5/250 2026-04-18 08:28 by babysonlkd
[考研] 化工学硕294分,求导师收留 +33 yzyzx 2026-04-12 37/1850 2026-04-17 23:00 by wunaiy88
[考博] 求博导|生物质基多孔碳/超级电容方向,已有相关成果,寻能源材料/碳材料方向老师 +3 猪猪人Zzz 2026-04-12 3/150 2026-04-17 19:10 by 阳阳阳^_^
[考研] 一志愿沪9,326求生物学调剂 +11 刘墨墨 2026-04-13 11/550 2026-04-17 15:35 by wanganpin
[考研] 材料相关专业344求调剂双非工科学校或课题组 +23 hualkop 2026-04-12 25/1250 2026-04-16 22:12 by SUSE_CL
[考研] 294求调剂 +14 淡然654321 2026-04-15 14/700 2026-04-16 21:01 by lpl364211
[考研] 一志愿沪9,生物学326求调剂 +9 刘墨墨 2026-04-15 9/450 2026-04-16 17:14 by 崔崔崔cccc
[考研] 327求调剂 +26 Xxjc1107. 2026-04-13 29/1450 2026-04-16 10:52 by Espannnnnol
[考研] 279学硕食品专业求调剂院校 20+7 孤独的狼爱吃羊 2026-04-12 29/1450 2026-04-16 09:00 by screening
[考研] 求调剂学校 +14 不会吃肉 2026-04-13 16/800 2026-04-15 21:59 by noqvsozv
[考研] 一志愿A区211,22408 321求调剂 +6 随心所欲☆ 2026-04-15 7/350 2026-04-15 21:45 by lbsjt
[考研] 通信工程求调剂!!! +6 zlb770521 2026-04-14 6/300 2026-04-15 20:00 by 学员JpLReM
[考研] 0854调剂 +13 长弓傲 2026-04-12 16/800 2026-04-15 13:45 by fenglj492
[考研] 245求调剂 +6 冰糖橘?汽水 2026-04-13 10/500 2026-04-14 10:49 by jyl0317
[考研] 考研求调剂 +12 子木呐 2026-04-12 13/650 2026-04-14 01:19 by 王珺璞
[考研] 2026硕士调剂_能动_河南农业大学 +4 河南农业大学-能 2026-04-12 4/200 2026-04-13 22:01 by bljnqdcc
[考研] 302求调剂 +10 易!? 2026-04-13 10/500 2026-04-13 19:04 by lbsjt
[考研] 290求调剂 +18 柯淮然 2026-04-12 20/1000 2026-04-13 12:56 by cyh—315
[考研] 0831一轮调剂失败求助 +10 小熊睿睿_s 2026-04-11 10/500 2026-04-12 22:43 by 长弓傲
信息提示
请填处理意见