24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 1618  |  回复: 5
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

violin0301

银虫 (初入文坛)

[求助] 求教DNA序列建树问题。谢谢 已有2人参与

如题。

我在NCBIblast比对后按顺序选择15个相似序列建树如图1,以及选择前50个相似序列中的9个不同种属结果建树如图2
请问,哪种是对的?而且,建起来的树感觉怪怪的,而且附件1中,我的序列与哪个更相近呢?
偶完全没有这方面的知识,拜求各位不吝赐教!

谢谢
求教DNA序列建树问题。谢谢
图片1.jpg


求教DNA序列建树问题。谢谢-1
图片2.png
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lyt26802

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by violin0301 at 2013-12-31 21:19:28
是啊,我的树是用mega6作的,NJ法,我觉得应该是相似序列没选好,但我不是很清楚选的原则...

一般选类比菌株的时候尽量多选那些带有菌株保藏中心编号的 比如ATCC的,这样会比较准确,多选一些 多做几次 图就好看了

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

5楼2014-01-04 21:14:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

lyt26802

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
violin0301: 金币+5, 有帮助 2014-01-02 19:25:58
一般不是都用blast软件及mega5作图么
2楼2013-12-31 20:34:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

violin0301

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lyt26802 at 2013-12-31 20:34:01
一般不是都用blast软件及mega5作图么

是啊,我的树是用mega6作的,NJ法,我觉得应该是相似序列没选好,但我不是很清楚选的原则
3楼2013-12-31 21:19:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bikexmx

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
violin0301: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-01-02 19:25:47
个人认为结果是差不多的,都是跟Gibberella intermedia相似性最高,但是60几这个分值并不高
前方总有更多挑战,战胜恐惧,勇往向前,加油~~~~
4楼2014-01-02 11:21:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 307中医考研调剂 +9 于以采蘩 2026-04-14 9/450 2026-04-19 08:41 by 烟雨流涯
[考研] 0854求调剂 +23 门路摸摸 2026-04-15 27/1350 2026-04-19 01:59 by 烟雨流涯
[考研] 297,工科调剂? +5 河南农业大学-能 2026-04-14 5/250 2026-04-18 15:17 by Equinoxhua
[考研] 收到复试调剂但是去不了 +8 小蜗牛* 2026-04-16 8/400 2026-04-18 11:15 by zixin2025
[考研] 260求调剂 +4 Zyt1314520.. 2026-04-17 5/250 2026-04-18 08:28 by babysonlkd
[考博] 申博/考博 +3 啃面包的小书虫 2026-04-17 4/200 2026-04-17 23:54 by 阳阳阳^_^
[考研] 求调剂 +9 小聂爱学习 2026-04-16 11/550 2026-04-17 22:34 by chixmc
[有机交流] 二苯甲酮酸类衍生物 50+3 小白爱主人 2026-04-17 6/300 2026-04-17 18:47 by kf2781974
[考研] 一志愿中科大材料与化工,353分还有调剂学校吗 +10 否极泰来2026 2026-04-15 12/600 2026-04-17 17:54 by mapenggao
[考研] 294求调剂 +7 淡然654321 2026-04-17 8/400 2026-04-17 16:36 by wutongshun
[考研] 297,工科调剂? +10 河南农业大学-能 2026-04-14 10/500 2026-04-15 21:50 by noqvsozv
[教师之家] 转长聘了 +7 简单化xn 2026-04-13 7/350 2026-04-14 14:50 by xindong
[考研] 求调剂 +12 何气正 2026-04-13 13/650 2026-04-14 14:47 by zs92450
[考研] 245求调剂 +6 冰糖橘?汽水 2026-04-13 10/500 2026-04-14 10:49 by jyl0317
[考研] 085600材料与化工329分求调剂 +24 叶zilin 2026-04-13 25/1250 2026-04-14 09:20 by 试管破裂
[考研] 考研求调剂 +12 子木呐 2026-04-12 13/650 2026-04-14 01:19 by 王珺璞
[考研] 考研英一数一338分 +9 长江大学东校区 2026-04-13 10/500 2026-04-14 00:41 by 王珺璞
[考研] 2026硕士调剂_能动_河南农业大学 +4 河南农业大学-能 2026-04-12 4/200 2026-04-13 22:01 by bljnqdcc
[考研] 一志愿中南大学 0855 机械 286 求调剂 +11 不会吃肉 2026-04-12 11/550 2026-04-13 21:59 by bljnqdcc
[考研] 297工科,求调剂? +13 河南农业大学-能 2026-04-12 13/650 2026-04-13 14:12 by dingyanbo1
信息提示
请填处理意见