应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】请高人帮我详尽的分析一段DNA序列
181/2返回列表12下一页
查看: 2388  |  回复: 17
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

heihei3910

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】请高人帮我详尽的分析一段DNA序列 已有12人参与

请高人帮我详尽的分析一段DNA序列。
我的这段DNA序列是利用兼并引物从一个放线菌的基因组DNA中扩增出来的。
希望高人能非常详尽的分析一下这段序列与哪个基因同源性最高？保守序列在哪里？有保守结构域吗？同时能够与最同源的一些做个聚类分析。总之是越详细越好。

灌水的不要啊！！！

ATTCCACTGGGCGCCATGGCCGGAAAACTTCACCGAGTCGTAGTTGGTGCCGAAGGCCCCCGCGTCGACCAGTTCCCTGATCTTGCCCAACGCCTTGCGGCTGTCCGGGCTCGCCCAGACCTCCCGGTCGCCCGCGAGCGCCTTCTCGAAGAGTTCCGGGCCGGCGATGCGGTCGTAGAGGTACTCGAACCACATCAGTGTCGGCCACCGGTCGCCGCCGCCCAGCGCGATCGGGGTGACGCCGTCCGACTTCAGCGCTTTGACCGCCGCGAGCAGGTCGTCCCAGGTCTCGGGCGGTTCGACGCCCGCCTTCTTCAGGACCTTGCCGTTGTGGGAGAGCAGCACGGGCTGCGTCCCGCGCATGGGGACCCCGTAGGAGGCGCCGTCGACCACCGCGCTGTTGAAGACGGACGGCAGGAACTTCTCCTTGAGGGCGGGGTCCTCCTCGATGAACGGGTCCAGCGGGAGCAACAGGTCGGCGTCGACGAACGGCTTGATGCTGCCGCCGCCCCAGTTGAAGAAGACGTCGGACGCCTGCTTGCTGTTGATGATCGTCTGGAGTTTGGCCTGGTAGTCGGCGCCCGGGATGGTGTCCAGGACGGCCTTCACCTTCGACGTCTTGTTGAAGGTGGCGACGATCTCCTTCTCCACCTTGTTCGCCGCGTCCCCGTCCCGTGCGCCTCAAT
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2010-06-24 20:13:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tianlus1632

木虫 (正式写手)
直接用ncbi里的blast分析就可以拉
赞一下 回复此楼
2楼2010-06-24 20:31:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuyixst

木虫 (正式写手)
这个不用高手就可以
赞一下 回复此楼
3楼2010-06-24 20:37:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ben1147

木虫 (正式写手)
★
lstt09nk(金币+1):呵呵，感觉像丢东西似的~~ 2010-06-29 19:05:47
http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Bl ... ;LINK_LOC=blasthome

序列丢进去，database选others，点最下边的BLAST，等结果吧
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2010-06-24 20:42:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

heihei3910

铜虫 (小有名气)

你们给的并不是我要的答案

你们给的并不是我要的答案
去NCBI里比对我也非常熟悉，我的意思是，比对完了后，确实有同源性很高的序列，然后调出该序列后，继续详尽的分析，怎么搞？
赞一下 回复此楼
5楼2010-06-24 21:09:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ben1147

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
scelab(金币+3):谢谢交流！:tiger06: 2010-06-24 23:38:18
引用回帖:
Originally posted by heihei3910 at 2010-06-24 21:09:39:
你们给的并不是我要的答案
去NCBI里比对我也非常熟悉，我的意思是，比对完了后，确实有同源性很高的序列，然后调出该序列后，继续详尽的分析，怎么搞？

什么叫怎么搞？
”详尽的分析“指什么？不说清楚没办法

最简单的，blast结果里面找到相似度高的序列，然后拿到这些序列
clustalW比对对齐，分析同源区
MEGA建树

具体做什么东西要看你的目的了，找本生物信息的书看，上面都有
赞一下(1人) 回复此楼
6楼2010-06-24 21:45:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

scelab

荣誉版主 (文坛精英)

小木虫之有关部门负责人
引用回帖:
Originally posted by heihei3910 at 2010-06-24 21:09:39:
你们给的并不是我要的答案
去NCBI里比对我也非常熟悉，我的意思是，比对完了后，确实有同源性很高的序列，然后调出该序列后，继续详尽的分析，怎么搞？

你的要求貌似比较高。

要满足你的要求的，得对你研究的菌背景有所了解~~~或者同行
赞一下 回复此楼
小木虫之有关部门负责人
7楼2010-06-24 23:39:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

silicare

荣誉版主 (文坛精英)

合伙创业版兼职版主

优秀版主
★
看天(金币+1):很活跃的虫友～～～ 2010-06-29 18:06:38
  你的要求太高了 至少得浪费别人半天时间
赞一下(1人) 回复此楼
8楼2010-06-25 08:18:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liyong1981

金虫 (正式写手)
这，这要半天，分析好的话，给钱~！
赞一下 回复此楼
9楼2010-06-25 17:01:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

heihei3910

铜虫 (小有名气)
你们这些家伙都是在这里放大话，具体的啥也说不清楚，还赖别人没有表达清楚，服了你们了啊！！！！！！
赞一下 回复此楼
10楼2010-06-29 17:55:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 heihei3910 的主题更新
181/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 东南大学364求调剂 +4 JasonYuiui 2026-03-15 4/200 2026-03-16 08:36 by Linda Hu
[考研] 化学工程321分求调剂 +6 大米饭！ 2026-03-15 6/300 2026-03-16 07:58 by wang_dand
[考研] 材料工程专硕274一志愿211求调剂 +5 薛云鹏 2026-03-15 5/250 2026-03-15 20:38 by Logic2024
[考研] 0856专硕279求调剂 +5 加油加油！? 2026-03-15 5/250 2026-03-15 11:58 by 2020015
[考研] 本科南京大学一志愿川大药学327 +3 麦田耕者 2026-03-14 3/150 2026-03-14 20:04 by 外星文明
[考研] 材料与化工 323 英一+数二+物化，一志愿：哈工大 本人本科双一流 +4 自由的_飞翔 2026-03-13 5/250 2026-03-14 19:39 by hmn_wj
[考研] 297一志愿上交085600求调剂 +5 指尖八千里 2026-03-14 5/250 2026-03-14 17:26 by a不易
[基金申请] 现在如何回避去年的某一个专家，不知道名字 +3 zk200107 2026-03-12 6/300 2026-03-14 17:13 by zk200107
[考研] 【0703化学调剂】-一志愿华中师范大学-六级475 +5 Becho359 2026-03-11 5/250 2026-03-14 11:35 by 哦哦123
[考研] 308 085701 四六级已过求调剂 +7 温乔乔乔乔 2026-03-12 14/700 2026-03-14 10:49 by JourneyLucky
[考研] 考研材料与化工，求调剂 +8 戏精丹丹丹 2026-03-09 8/400 2026-03-14 01:14 by JourneyLucky
[考研] 307求调剂 +7 超级伊昂大王 2026-03-10 7/350 2026-03-14 00:49 by JourneyLucky
[考研] 材料工程专硕，一志愿中国矿业大学，总分314，求调剂 +5 无懈可击的巨人 2026-03-10 5/250 2026-03-14 00:37 by JourneyLucky
[考研] 材料371求调剂 +9 鳄鱼? 2026-03-11 11/550 2026-03-13 22:53 by JourneyLucky
[硕博家园] 深圳大学硕士招生（2026秋，传感器方向，仅录取第一志愿） +4 xujiaoszu 2026-03-11 7/350 2026-03-13 17:28 by xujiaoszu
[考研] 【0856】化学工程（085602）313 分，本科学科评估A类院校化学工程与工艺，诚求调剂 +7 小刘快快上岸 2026-03-11 7/350 2026-03-13 16:06 by ruiyingmiao
[考研] 295求调剂 +3 小匕仔汁 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:17 by vgtyfty
[考研] 0817化学工程与技术考研312分调剂 +3 T123 tt 2026-03-12 3/150 2026-03-13 10:49 by houyaoxu
[考研] 材料专硕274一志愿陕西师范大学求调剂 +4 薛云鹏 2026-03-13 4/200 2026-03-13 10:40 by 学员8dgXkO
[考博] 2026年博士申请 +3 QwQwQW10 2026-03-11 3/150 2026-03-12 17:58 by gxch43
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭