24小时热门版块排行榜    

查看: 1580  |  回复: 5

violin0301

银虫 (初入文坛)

[求助] 求教DNA序列建树问题。谢谢 已有2人参与

如题。

我在NCBIblast比对后按顺序选择15个相似序列建树如图1,以及选择前50个相似序列中的9个不同种属结果建树如图2
请问,哪种是对的?而且,建起来的树感觉怪怪的,而且附件1中,我的序列与哪个更相近呢?
偶完全没有这方面的知识,拜求各位不吝赐教!

谢谢
求教DNA序列建树问题。谢谢
图片1.jpg


求教DNA序列建树问题。谢谢-1
图片2.png
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lyt26802

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
violin0301: 金币+5, 有帮助 2014-01-02 19:25:58
一般不是都用blast软件及mega5作图么
2楼2013-12-31 20:34:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

violin0301

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lyt26802 at 2013-12-31 20:34:01
一般不是都用blast软件及mega5作图么

是啊,我的树是用mega6作的,NJ法,我觉得应该是相似序列没选好,但我不是很清楚选的原则
3楼2013-12-31 21:19:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bikexmx

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
violin0301: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-01-02 19:25:47
个人认为结果是差不多的,都是跟Gibberella intermedia相似性最高,但是60几这个分值并不高
前方总有更多挑战,战胜恐惧,勇往向前,加油~~~~
4楼2014-01-02 11:21:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lyt26802

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by violin0301 at 2013-12-31 21:19:28
是啊,我的树是用mega6作的,NJ法,我觉得应该是相似序列没选好,但我不是很清楚选的原则...

一般选类比菌株的时候尽量多选那些带有菌株保藏中心编号的 比如ATCC的,这样会比较准确,多选一些 多做几次 图就好看了

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

5楼2014-01-04 21:14:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

violin0301

银虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by lyt26802 at 2014-01-04 21:14:39
一般选类比菌株的时候尽量多选那些带有菌株保藏中心编号的 比如ATCC的,这样会比较准确,多选一些 多做几次 图就好看了...

谢谢赐教,我再作图看看
6楼2014-01-08 14:42:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 violin0301 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 0703化学336分求调剂 +5 zbzihdhd 2026-03-15 6/300 2026-03-18 04:34 by anny19840123
[考研] 304求调剂 +9 小熊joy 2026-03-14 9/450 2026-03-18 04:33 by anny19840123
[考研] 070300化学319求调剂 +4 锦鲤0909 2026-03-17 4/200 2026-03-17 18:21 by 重科小霸王
[考研] 302求调剂 +9 负心者当诛 2026-03-11 9/450 2026-03-17 17:13 by ruiyingmiao
[考研] 求调剂,总分315,考的生物医药,一志愿湖南师范大学。调剂到任何专业都可以 +4 小丁想进步 2026-03-11 5/250 2026-03-17 16:05 by 外星文明
[考研] 283求调剂 +3 听风就是雨; 2026-03-16 3/150 2026-03-17 07:41 by 热情沙漠
[考研] 化学调剂0703 +8 啊我我的 2026-03-11 8/400 2026-03-16 17:23 by 我的船我的海
[考研] 318求调剂 +3 Yanyali 2026-03-15 3/150 2026-03-16 16:41 by houyaoxu
[考研] 0703化学调剂 +6 妮妮ninicgb 2026-03-15 9/450 2026-03-16 16:40 by houyaoxu
[考研] 机械专硕调剂 +3 笨笨兔子 2026-03-12 3/150 2026-03-15 20:02 by 栗子粥?
[考研] 288求调剂 +4 奇点0314 2026-03-14 4/200 2026-03-14 23:04 by JourneyLucky
[考研] 255求调剂 +3 李嘉慧, 2026-03-12 4/200 2026-03-14 16:58 by 有只狸奴
[考研] 一志愿西南交大,材料专硕317求调剂 +5 lx8568 2026-03-11 5/250 2026-03-13 21:43 by peike
[考研] 333求调剂 +3 球球古力 2026-03-11 3/150 2026-03-13 21:27 by JourneyLucky
[硕博家园] 085600 260分求调剂 +3 天空还下雨么 2026-03-13 5/250 2026-03-13 18:46 by 天空还下雨么
[考研] 考研调剂 +4 芬达46 2026-03-12 4/200 2026-03-13 16:04 by ruiyingmiao
[考研] 材料301分求调剂 +5 Liyouyumairs 2026-03-12 5/250 2026-03-13 14:42 by JourneyLucky
[考研] 070303一志愿西北大学学硕310找调剂 +3 d如愿上岸 2026-03-13 3/150 2026-03-13 10:43 by houyaoxu
[考研] 321求调剂(食品/专硕) +3 xc321 2026-03-12 6/300 2026-03-13 08:45 by xc321
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +3 崔wj 2026-03-12 4/200 2026-03-12 19:33 by 求调剂zz
信息提示
请填处理意见