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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 如何将小分子Jmol格式转化为pdb格式
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smy897579

铜虫 (小有名气)

[求助] 如何将小分子Jmol格式转化为pdb格式已有3人参与

本人想做分子对接，一直处于摸索阶段，听说要找到小分子和蛋白的pdb文件，蛋白的已经有了，可是小分子的没有pdb格式，下了Jmol格式的，请问大神，该怎么改格式呢，或是有没有其他的办法进行对接。谢谢！
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1楼2013-12-17 15:40:18
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wbingxin2012

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2013-12-19 12:37:27
smy897579(月只蓝代发): 金币+2, 鼓励交流！ 2014-05-31 21:20:41
SYBYL本身带了截图功能，设置大点的DPI就可以了，但是前提是你的电脑支持那么大图像输出，显卡要好
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2楼2013-12-18 13:42:57
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笑笑愁

金虫 (小有名气)

未知

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2013-12-19 12:37:35
smy897579(月只蓝代发): 金币+1, 鼓励交流！ 2014-05-31 21:20:49
建议楼主试试VMD，一个很强大的软件，很多要编程处理的问题它都可以解决
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有志者，事竟成。
3楼2013-12-19 09:21:58
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fengxinzi78

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2013-12-21 09:11:04
smy897579(月只蓝代发): 金币+1, 鼓励交流！ 2014-05-31 21:20:54
下一个openbabel软件，转换一下格式就可以了
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Acontentedmindisaperpetualfeast!
4楼2013-12-20 16:12:37
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huterx

金虫 (小有名气)
学习一下 万一以后用到呢
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5楼2013-12-20 19:44:51
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