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永远一片天

新虫 (正式写手)

[求助] 找到一对细菌的通用引物,大家看下为什么会有简并碱基

引物里面有简并碱基到底是好呢,还是不好,求解答GAGAGTTTGATCCTGGCTCAG 和GWATTACCGCGGCKGCTG位置是27到561左右,这样的引物据说是灵敏性高,可以检测出细菌,我做的实验目的不是测序,只要证明样本里面有细菌就行了,求高手解答,这样的引物可以吗?
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lm2570

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 永远一片天 at 2013-12-03 19:00:18
这样产物长度会不会太长,1500bp左右,一般的酶好像活性都不够的,我怕扩不出来。...

没问题的,我做过很多次,前一个是27F ,刚才打掉了一个字

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4楼2013-12-03 19:20:38
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lm2570

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
永远一片天: 金币+3, ★★★很有帮助 2013-12-03 19:00:36
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2013-12-03 20:22:33
7F:5’-AGAGTTTGATCCATGGCTCAG-3’;1541R:5’-AAGGAGGTGATCCAGCC-3’
2楼2013-12-03 18:13:19
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永远一片天

新虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lm2570 at 2013-12-03 18:13:19
7F:5’-AGAGTTTGATCCATGGCTCAG-3’;1541R:5’-AAGGAGGTGATCCAGCC-3’

这样产物长度会不会太长,1500bp左右,一般的酶好像活性都不够的,我怕扩不出来。
3楼2013-12-03 19:00:18
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永远一片天

新虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by lm2570 at 2013-12-03 19:20:38
没问题的,我做过很多次,前一个是27F ,刚才打掉了一个字...

啊,师姐好!那退火温度大概设置多少?这对引物可以扩增出大多数的细菌16SrRNA的吗
5楼2013-12-03 19:33:25
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