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引物设计时总是发生严重错配怎么办?敬请大家指点! 已有2人参与
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我要设计一对Real-Time PCR(染料法)的引物,但是由于目的序列自身碱基重复较多,设计引物时经常发生错配,软件(PrimerPremier5)给出的100对引物都有错配,最好的情况也是其中一条正向引物或反向引物有错配。 请教一下这种情况下应该怎么设计引物? 另外,设计出的引物在NCBI上BLAST,应该以哪一项评分为选择依据,是主要看Query coverage吗?可是有时Query coverage100%不一定排在前面。 第一次设计引物,请大家多多指教! 谢谢! [ Last edited by 小虫之老虫 on 2009-10-24 at 15:46 ] |
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