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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 菌液pcr总是做不出！求高手解答！
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winnerfc

新虫 (小有名气)

[交流] 菌液pcr总是做不出！求高手解答！

我用takara的rTAQ酶做菌液PCR，总是没有目的条带，只有引物带，抽质粒酶切鉴定后证明是有阳性菌的，可是菌液pcr上没有条带。
           
            我用的体系如下： rtaq酶   5ul，引物1  0.2ul，引物2  0.2ul，菌液  1ul ，去离子水   3.6ul。 pcr程序就是用的rtaq酶说明书上的程序。（我换了一个高保真的酶也做过，是可以扩出目的条带的）

到底问题出在哪里呢？
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1楼 2013-11-01 09:38:00
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sun_in_night

木虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
我觉得是不应该拿菌液做模板，1ul里面的菌太少了，除非你离心后再增加浓度了。其实还是菌落里面的菌多，所以直接菌落PCR就行。
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6楼2013-11-02 03:20:40
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肖颖2009

铁虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
wizardfan: 金币+2, 谢谢参与 2013-11-02 10:22:13
winnerfc: 金币+5 2013-11-02 11:29:37
你可以用质粒作为模板来扩，质粒需要稀释，根据跑胶浓度来确定怎么稀释。一般是稀释50~100倍。有时候因为仪器或者程序设置原因导致菌液里的菌体细胞壁不能完全破坏，不能释放出DNA，没有模板的话肯定扩不出来的。可以试试，等你好消息！
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2楼2013-11-01 11:44:05
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肖颖2009

铁虫 (正式写手)
★ ★
wizardfan: 金币+2, 大家来找茬 2013-11-02 10:22:48
哦 对了   你的这个体系有问题啊   应该还有dNTP  和 酶配套的buffer吧？
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3楼2013-11-01 11:45:23
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cccooo000

禁虫 (初入文坛)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
wizardfan: 金币+2, 谢谢分享经验 2013-11-02 10:22:24
本帖内容被屏蔽
4楼2013-11-01 16:40:38
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winnerfc11楼
2013-11-02 11:31   回复  
引用回帖:
7楼: Originally posted by jinwei331 at 2013-11-02 06:54:47 …………………………

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