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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » PCR引物必须与目的基因片段的一小段序列互补吗？急！！！
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pycraze

木虫 (小有名气)

[求助] PCR引物必须与目的基因片段的一小段序列互补吗？急！！！

跑PCR前，设计引物时，引物序列必须是与目的基因片段的一小段序列互补的吗？还是可以在目的基因序列以外设计引物呢?急！！！
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1楼 2013-10-09 22:09:33
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰，手有余香。分子生物期待更详细的解答 2013-10-10 09:56:47
要看你PCR的目的是什么。如果是克隆基因片段，引物的位置是大致固定的，如果是检测样本中是否有目的片段，引物选取的自由度较大，位置比较随意。
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3楼2013-10-10 03:24:59
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liyongliangx

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰，手有余香。分子生物期待更详细的解答 2013-10-10 09:56:41
随意啊，只要能扩增到你需要的片段就行了。
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2楼2013-10-09 22:40:18
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pycraze

木虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-10-10 03:24:59
要看你PCR的目的是什么。如果是克隆基因片段，引物的位置是大致固定的，如果是检测样本中是否有目的片段，引物选取的自由度较大，位置比较随意。

那如果是克隆基因片段，引物的位置大致固定在哪儿？那要是克隆基因全长呢，引物的位置在哪儿比较好？多谢指教~
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4楼2013-10-10 08:20:00
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pycraze

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by liyongliangx at 2013-10-09 22:40:18
随意啊，只要能扩增到你需要的片段就行了。

提取目的基因不是有一种叫做“同源序列法”的吗，这个需要先进行序列收集比对，再设计兼并引物，那序列比对的话就只能比对目的基因的序列噻，目的基因以外的序列就没法比对啊，那岂不是设计出的兼并引物只能是与目的基因片段的一小段序列互补呢？就不随意了啊。那在什么情况下随意呢？请指教~
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5楼2013-10-10 08:25:49
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