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下雨了吗__

铁杆木虫 (小有名气)

[求助] 离子交换蛋白纯化

我做蛋白纯化,采用的是SP离子交换,采用线性洗脱,一般蛋白在洗脱液6-15%的时候出峰,但后来我配溶液用的pH计有些不准了,所以配的冲平缓冲液和洗脱液pH均有些不准,然后做AKTA,在上述区间出了极小的峰(取名峰1,2,3),洗脱液升到17%左右时(一般这种情况就不会再出目标峰了)我就将洗脱液调至100%,洗杂蛋白,结果出了很高的峰(峰4),而且电泳结果显示,峰1,2,3,4均含目标蛋白。问:a:为什么线性洗脱时目标峰总是出好几个峰呢,以前的也是,怎样才能让它变成一个峰呢,跟我的洗脱方式有关吗?b:峰4按以前是没有目标蛋白的,但这次含量很高,是我的缓冲液pH改变了,所以出峰的位置改变,可能大于17%了?还是我的柱子出了问题呢?请高手指教
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wolfman840

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wizardfan: 金币+3, 谢谢分析 2013-08-27 06:10:02
下雨了吗__: 金币+2 2013-08-28 08:48:03
1.你的目标蛋白的带电情况和分子量不一致,正常处于一个范围内,因此做线性洗脱时会有几个不一样的峰出来,尤其是当你的填料颗粒比较细小和均匀的时候。
2.这次你pH不对,其实你应该有目的的延长一下线性洗脱的梯度,既然知道问题所在,再进行一个实验验证一下就可以了。
3.柱子只要在正确的条件下出峰情况一致就没有坏,及时用清洗液清洗再生,保护好柱子。
2楼2013-08-26 12:23:01
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wangchclove

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
wizardfan: 金币+1, 谢谢参与 2013-08-27 06:09:52
a:杂蛋白的干扰,再就是分子间有没有二硫键 单体 多聚体之类的 加没加DTT;
b:很可能是Ph的关系,影响还是挺大的
Good
3楼2013-08-26 20:24:24
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下雨了吗__

铁杆木虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by wangchclove at 2013-08-26 20:24:24
a:杂蛋白的干扰,再就是分子间有没有二硫键 单体 多聚体之类的 加没加DTT;
b:很可能是Ph的关系,影响还是挺大的

没有二硫键,有一个半胱氨酸。以前纯化的蛋白没有半胱氨酸的时候也会出现两个目标峰
4楼2013-08-27 08:26:08
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下雨了吗__

铁杆木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by wolfman840 at 2013-08-26 12:23:01
1.你的目标蛋白的带电情况和分子量不一致,正常处于一个范围内,因此做线性洗脱时会有几个不一样的峰出来,尤其是当你的填料颗粒比较细小和均匀的时候。
2.这次你pH不对,其实你应该有目的的延长一下线性洗脱的梯度 ...

同一种蛋白怎么会带电情况不一样呢
5楼2013-08-27 08:27:22
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yakir

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
下雨了吗__: 金币+2 2013-08-28 08:48:19
a. 蛋白表达后的修饰不一定一样的,举个例子,同一蛋白,部分可能被磷酸化,部分没有,表面电荷就会不一样的等等。。。同一蛋白在线性洗脱下出现几个峰是很正常的,尤其是线性时间长,填料分辨率高的情况下。尤其是做蛋白结晶的,更需要把不同修饰的同一蛋白分开,才能尽量保证蛋白的均一性,有利于晶体形成。
  希望出现同一峰的话,你直接30%洗脱,肯定就只有一个峰,或者换换分辨率比较低的柱子,再或者减少线性洗脱的时间,基本上都可以得到一个峰。
b. PH改变了一般会影响出峰时间的,所以PH计每次用前最好校准,如果你懒得校准,你可以直接测一下校准液看看PH是否有区别,如果有再校准,没有的话就可以使用了。
一步一步!
6楼2013-08-27 10:00:58
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joux19

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
学习了,希望这个帖子可以多讨论
7楼2013-08-27 10:22:37
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wolfman840

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


下雨了吗__: 金币+1 2013-08-28 08:48:28
引用回帖:
6楼: Originally posted by yakir at 2013-08-27 10:00:58
a. 蛋白表达后的修饰不一定一样的,举个例子,同一蛋白,部分可能被磷酸化,部分没有,表面电荷就会不一样的等等。。。同一蛋白在线性洗脱下出现几个峰是很正常的,尤其是线性时间长,填料分辨率高的情况下。尤其是 ...

解释的不错,另外补充一个,同一个目的蛋白,他也可能有聚体,片段等等的形式,也会造成出不同的峰,而且蛋白表达也是灵活的,可能少几个氨基酸,分子量差几个KD,那峰就差远了。
8楼2013-08-27 10:23:55
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葡萄王子

铁虫 (初入文坛)


PH不准你可以矫正一下,很简单的
9楼2014-10-13 10:38:19
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