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liuyi8203

金虫 (小有名气)

[求助] PCR退火温度 Tm值

合成了引物,引物单子上的 %GC, %GC  Tm,Therm. Tm分别表示什么意思?做PCR的时候应该选哪一个作为退火温度呢?谢谢!

[ Last edited by liuyi8203 on 2013-8-9 at 09:56 ]
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一直寂寞的鱼

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖应助! 2013-08-09 13:02:19
一般退火温度为上游引物的TM值和下游引物的TM值相加后除以2,再减3为一般 退火温度,但是不绝对,可以做梯度确定具体的退火温度!
幸福永远
2楼2013-08-09 09:57:17
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liuyi8203

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 一直寂寞的鱼 at 2013-08-09 09:57:17
一般退火温度为上游引物的TM值和下游引物的TM值相加后除以2,再减3为一般 退火温度,但是不绝对,可以做梯度确定具体的退火温度!

请看清楚题目,谢谢!
3楼2013-08-09 10:04:04
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nannanz2012

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流经验! 2013-08-09 13:02:28
我们一般以上下游引物的Tm值中的较小的那个减去3到5度,进行PCR扩增
4楼2013-08-09 10:06:00
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lpzl

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
退火温度Tm=(T+A)X 2+(G+C)X 4 — 5
Start_everyday_with_a_new_hope,_leave_bad_memories...
5楼2013-08-09 11:55:11
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任_强

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
amisking: 金币+4, MolEPI+1, 鼓励发帖交流! 2013-08-09 21:54:01
以上几个楼层都没看清题目呀,难怪楼主生气。首先,楼主设计引物,引物都买来了,竟然不知道引物质量好快的参数?
1.GC% 表示你设计的引物的G、C两个碱基的含量。G和C是以三个氢键相连,而T和A则是两个氢键相连的。氢键的多少能体现连接的能量,氢键多的不容易被打断。
2.Tm值。Tm值就是DNA裂解温度,指把DNA的双螺旋结构降解一半时的温度。不同序列的DNA,Tm值不同。DNA中G-C含量越高,Tm值越高,成正比关系。
3.therm就。 设计引物是有个关于能量的要求。你可以搜一下看看
4. 退火温度的话没有万能的公式。都是自己找的大概的值(这个值用5楼的公式计算就行),然后有目的的尝试。
好运。。
微生物行业的初学者,望大牛们不吝赐教
6楼2013-08-09 16:35:35
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堍仔

至尊木虫 (文坛精英)

优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
其实我觉得那个只是个参考吧,我一把引物回来我会自己做个温度梯度,这样比较好,如果一直就死死的用那个温度的话。。。。嗯。。。。那个撒
7楼2013-08-11 15:15:33
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