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同一个质粒的PCR结果和做出这个质粒的原来的RT-PCR结果不一样,什么原因呢??
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haitai2011
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2013-07-10 21:36:19
haitai2011: 金币+5
2013-07-11 21:01:24
RT-PCR结果和预期的一样吗?
出现这种结果,要是RT-PCR结果和预期的一样的话,有可能质粒是假阳,可用酶切鉴定一下,会不会有目的条带出来,PCR比较容易出现假阳。最准备的鉴定就是测序了
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2楼
2013-07-10 10:38:57
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关键是双酶切的小带和你的目的片段大小是不是一样的?不是一样的话,说明质粒是假阳了。再不放心的话,可测序
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4楼
2013-07-11 02:00:23
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难道片段和质粒发生重组?
我遇到过质粒和E.coli 的基因组发生重组的现象。
可以先测序看看序列。
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6楼
2013-07-11 12:11:46
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2013-07-11 21:00:45
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haitai2011
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双酶切的两条带 之和 和质粒的条带一样大,pcr也p亮了,但是就是和RT-PCR 结果不一样的...
双酶切的两条带之和,肯定会和质粒的条带一样
我觉得你这个质粒有九成是假阳性的
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8楼
2013-07-12 08:45:16
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haitai2011
at 2013-07-11 10:33:38
和我想要的目的条带不一样呢 差了快1000bp了
但是质粒PCR却P亮了...
质粒PCR的带和预期大小的带相差了1000bp,也有可能是质粒在细菌内增殖过程中发生了缺失。
前面我也说过,有可能是发生了重组。
这些情况我都遇到过。
只有测序才知道差的是哪一段以及其他详细信息。
另外,我不大赞同你的RT过程的问题。
你克隆肯定是RT后再PCR,得到正确长度的片段才进行后续的克隆,所以问题应该在克隆这一步,而不会与RT有关。
最后祝你实验顺利。
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9楼
2013-07-12 10:33:33
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