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飘零的叶子

新虫 (小有名气)

[求助] 蛋白透析过程中出现浑浊

我的目的蛋白是胞内可溶表达,破菌后离心取上清,将破碎上清对ph7.6的Tris-HCl缓冲液进行透析,透析过程中透析袋内出现浑浊,破菌缓冲液是含0.5M NaCl的ph8.5的Tris-HCl溶液,哪位大侠知道为什么透析过程中为什么会出现浑浊,该如何改进实验方案?!
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不转录的DNA

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+5, MolEPI+1, 中肯的建议! 2013-05-11 20:43:52
飘零的叶子: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-05-12 09:40:06
一般我们做蛋白先是破碎,再纯化,然后透析!
虽然不知道你破菌之后,透析蛋白用于干嘛?我猜可能是过阳离子柱是吧?
1).因为你破碎之后,上清中是含有许多种类蛋白的,蛋白浓度越高,protein越容易Aggregated,然后形成沉淀!可能沉淀的并不是你的蛋白,而是杂蛋白!
我经常将一部纯化之后!的蛋白流出,放置在4度,第二天观察发现蛋白变浑浊了,离了心之后,分别取上清与沉淀电泳,结果显示我的蛋白仍在上清!

2).通过透析换buffer来改变pH,可能会改变许多蛋白质的正确构象,使蛋白发生沉淀;也有可能是因为pH的改变刚好经过他的等电点,所以发生了沉淀!如果你的目的蛋白PI值在7.6~8.5之间,那么沉淀的可能是你的蛋白·····
3). 你的破碎buffer中含有500mM的盐,不知道你的透析buffer中含不含有?
总之,我也不知道你沉淀的蛋白是否是你的蛋白,你需要将其离心之后,分别取上清和沉淀跑一次SDS-PAGE!

你的方案得改进:
1. 最好在你的目的蛋白前加个标签,His或GST的。如果就只需要目的protein!!!那就在标签之后加个酶切位点吧!经过一步纯化之后,蛋白的浓度和纯度都会得到提高,一步纯化之后再透析不迟啊!
2.透析还是比较慢的,建议你用脱盐柱G25换你的buffer!
就这么多吧,希望能给你点建议!
长得比我英俊的,没我有才华!有才华的,没我长得俊!
2楼2013-05-11 15:35:50
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zhoupeng87

版主 (文学泰斗)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
是不是因为缓冲液是含0.5M NaCl
3楼2013-05-11 15:50:59
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草蔻年华

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
飘零的叶子(gyesang代发): 金币+1, 鼓励回帖应助! 2013-05-13 12:51:12
你的蛋白的等电点是多少,是不是蛋白析出了,可以调节透析液 的PH试试。
4楼2013-05-11 20:44:17
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
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飘零的叶子: 金币+3, 有帮助 2013-05-13 09:31:03
飘零的叶子(gyesang代发): 金币+1, 鼓励回帖应助! 2013-05-13 12:51:02
液体浑浊就是其中的溶质的溶解度低,提高溶质的溶解度即可。让溶液pH离开蛋白质的pI,但是太酸或太碱,以免蛋白质变性,引起更多浑浊;另外,可能是其他的非目的的杂质太多了,离心、分级沉淀、层析分离出目的蛋白质,许多时候杂质不好去除,那么就想方设法把分离出目的蛋白质即可,最好的办法之一:亲和层析,可以用GST,(His)6标签,也可以不用。直接用目的蛋白质制备当克隆抗体(可以交给生物技术公司去做,最多6个月应该可以),然后用抗体-抗原亲和层析柱分离提纯。
5楼2013-05-11 22:43:45
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不转录的DNA

金虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by yxncas-2012 at 2013-05-12 19:38:29
呵呵,感觉你对蛋白纯化这方面还是很懂的哈!...

不敢当!我只是做的多一点而已!
长得比我英俊的,没我有才华!有才华的,没我长得俊!
7楼2013-05-12 19:39:55
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yxncas-2012

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
飘零的叶子(gyesang代发): 金币+1, 鼓励回帖应助! 2013-05-13 12:51:21
1、你这个pH变化比较大,有些蛋白的pI值在你透析液附近,产生沉淀;
2、你的盐浓度下降的也太快,没有一个梯度;
3、破菌后的上清杂质太多,可以选择进行硫酸铵分布沉淀的方式初步除杂,然后再用你想用的buffer进行复溶盐析沉淀!
8楼2013-05-12 19:43:14
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不转录的DNA

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
飘零的叶子(gyesang代发): 金币+1, 鼓励跟贴交流! 2013-05-13 12:51:43
引用回帖:
10楼: Originally posted by 飘零的叶子 at 2013-05-13 09:16:58
试过用不含NaCl的破碎缓冲液,透析中还是会出现浑浊,跟NaCl的浓度有关系吗?加NaCl是为了增加蛋白的溶解度的吧,我想确认一下这个问题...

是的,许多蛋白在有盐和没盐的情况下的溶解性是不一样的!

适当的增加NaCL的含量可以提到蛋白的溶解性和蛋白复性的产率!
我想可能你的蛋白是盐溶性蛋白吧!
长得比我英俊的,没我有才华!有才华的,没我长得俊!
14楼2013-05-13 09:47:46
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不转录的DNA

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


飘零的叶子(gyesang代发): 金币+1, 鼓励跟贴交流! 2013-05-13 12:52:01
引用回帖:
15楼: Originally posted by 飘零的叶子 at 2013-05-13 09:55:03
我用不含NaCl的破碎缓冲液与含NaCl的破碎缓冲液分别破碎菌体以后跑电泳做了对照,我的目的蛋白的含量没有太大的区别,但是用不含NaCl的的破碎缓冲液破碎以后再透析的时候还是会出现浑浊,这个沉淀中的蛋白应该是没 ...

你的沉淀,我也不知道还有木有活性!你怎么溶出来呢?一般的溶解方法可能溶解不出来了,你可能需要用Urea或盐酸胍溶解了!那就变性了!变性了,你还得复性!不建议你用沉淀!
因为你的蛋白是上清蛋白,你的蛋白有标签吗?先过一下Ni柱或GST柱吧!
如果没有标签,那就过一下离子柱吧!

一步纯化之后的蛋白纯度高点,可能蛋白之间相互作用减少点,沉淀的可能性小一点吧!!!!

再问一下:你的蛋白PI值多少?
长得比我英俊的,没我有才华!有才华的,没我长得俊!
16楼2013-05-13 10:28:40
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不转录的DNA

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


飘零的叶子(gyesang代发): 金币+1, 鼓励跟贴交流! 2013-05-13 12:52:20
引用回帖:
17楼: Originally posted by 飘零的叶子 at 2013-05-13 10:40:45
我的蛋白没有标签,破碎上清可以直接上离子柱吗?不需要除盐吗?我用软件预测的蛋白等电点是8.56,但是不知道它的的具体构象所以实际的等电点并不能确定...

哦  !你的不除盐是不可以过离子柱的!!建议你:
先用硫酸铵分级沉淀初步纯化你的蛋白,是你的蛋白纯度更高点!!
再用脱盐柱G25脱盐试试!G25脱盐快速又方便!脱盐既是换buffer!
可以先取少量的脱盐试一试!看蛋白是否沉在柱子上!!
长得比我英俊的,没我有才华!有才华的,没我长得俊!
18楼2013-05-13 11:04:21
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普通回帖

yxncas-2012

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 不转录的DNA at 2013-05-11 15:35:50
一般我们做蛋白先是破碎,再纯化,然后透析!
虽然不知道你破菌之后,透析蛋白用于干嘛?我猜可能是过阳离子柱是吧?
1).因为你破碎之后,上清中是含有许多种类蛋白的,蛋白浓度越高,protein越容易Aggregated, ...

呵呵,感觉你对蛋白纯化这方面还是很懂的哈!
6楼2013-05-12 19:38:29
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飘零的叶子

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 不转录的DNA at 2013-05-11 15:35:50
一般我们做蛋白先是破碎,再纯化,然后透析!
虽然不知道你破菌之后,透析蛋白用于干嘛?我猜可能是过阳离子柱是吧?
1).因为你破碎之后,上清中是含有许多种类蛋白的,蛋白浓度越高,protein越容易Aggregated, ...

透析是为了除盐,然后上阳离子柱,透析中沉淀下来的蛋白中确实是含有我的目的蛋白的,透析液中是不含NaCl的,我也试过用不含NaCl的破碎缓冲液进行破碎然后在不含NaCl的Tris-HCl的缓冲液中进行透析,还是会有浑浊出现。我想问沉淀下来的蛋白会不会变性?可不可以用缓冲液溶解以后继续上到阳离子柱呢?!
9楼2013-05-13 09:15:40
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飘零的叶子

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by zhoupeng87 at 2013-05-11 15:50:59
是不是因为缓冲液是含0.5M NaCl

试过用不含NaCl的破碎缓冲液,透析中还是会出现浑浊,跟NaCl的浓度有关系吗?加NaCl是为了增加蛋白的溶解度的吧,我想确认一下这个问题
10楼2013-05-13 09:16:58
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