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徐乐XL

金虫 (小有名气)

[求助] 质粒酶切回收

请教一下各位大神,为什么我分步酶切质粒用试剂盒回收后测其浓度发现特别低,只有约不到8ng/ul,并且260/280比值竟然小于1,请教各位这是为什么?Sample Text
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★
感谢参与,应助指数 +1
徐乐XL(myprayer代发): 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,鼓励应助,分子生物版块期待你的更多精彩。同样期待你更详细的应助指导。 2013-05-09 08:16:25
质粒的初始用量是多少?回收率应该在50-80%左右。如果你的回收率小于20%的话是有问题的。
2楼2013-05-09 02:25:27
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lvanmorison

禁虫 (初入文坛)

★
感谢参与,应助指数 +1
徐乐XL(gyesang代发): 金币+1, 鼓励回帖应助! 2013-05-09 20:46:23
本帖内容被屏蔽

3楼2013-05-09 10:51:18
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徐乐XL

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-05-09 02:25:27
质粒的初始用量是多少?回收率应该在50-80%左右。如果你的回收率小于20%的话是有问题的。

初始浓度为70ng/ul左右,我比明白的是为什么260/280比值那么小,是因为里面的酶没有去掉吗?
4楼2013-05-09 19:44:23
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徐乐XL

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by lvanmorison at 2013-05-09 10:51:18
分布酶切一般是因为最适宜温度,和buffer的问题。
你可以换种方法,比如,第一种没切后,使用醋酸钠以及无水乙醇来沉淀质粒片段,然后重新溶解,再进行第二次酶切,这次回收用凝胶回收试剂盒。因为回收试剂盒回收效 ...

谢谢,学到了新的方法。我想问一下为什么260/280比值那么低呢?是因为有酶回收时没有去掉吗?
5楼2013-05-09 19:46:03
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
徐乐XL: 金币+3 2013-05-10 22:29:42
引用回帖:
4楼: Originally posted by 徐乐XL at 2013-05-09 19:44:23
初始浓度为70ng/ul左右,我比明白的是为什么260/280比值那么小,是因为里面的酶没有去掉吗?...

有可能是蛋白杂质的影响,也有可能是因为样品浓度太低,A260/A280测得不准确。
6楼2013-05-10 01:12:53
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2009107082

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你初始浓度是多少,两次酶切都跑胶然后回收吗,如果这样的话回收率肯定低。如果切下来的是小片段,可以不用凝胶电泳,直接将酶切产物用胶回收试剂盒回收,这样回收率会高点。
7楼2013-05-10 15:29:47
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