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朝着江河走

金虫 (小有名气)

[交流] 如何解释这个PCR结果? 已有17人参与

连续两次了,PCR结果都是这样,DNA提取没问题。不知道是什么原因,与引物有关吗?

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rongduoyan

铜虫 (小有名气)

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gyesang: 金币+1, 鼓励回帖交流! 2013-05-01 18:56:05
gyesang: 回帖置顶 2013-05-01 18:56:07
查找原因关键是多做对照,楼主可以用别人做出来的引物,最好是内参基因按照别人做出来的条件用自己提的DNA做模版,先P一个看,如果有说明不是你DNA提取的问题,是引物的问题,如果没有,可能要考虑你模版以及PCR体系的问题,如果是所有的东西用的别人的,只有模版是自己的,那很好确认是模版的问题还是PCR的问题了,楼主多做对照吧!
23楼2013-05-01 12:45:11
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dafeizizhu

铜虫 (小有名气)

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gyesang: 金币+1, 鼓励回帖交流经验! 2013-05-01 18:54:34
要找出具体原因,我建议先从引物入手。我个人经验,引物是绝对关键的问题,拿到引物之后,先找到合适的退火温度,再进行实验。一般是先做个梯度PCR,找到合适的退火温度;再寻找合适的循环数等问题,,,,,,
11楼2013-04-28 10:49:52
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kkzzll0624

铁杆木虫 (小有名气)

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gyesang: 金币+1, 鼓励回帖应助! 2013-05-01 18:54:48
基因组Dna跑个胶,引物核实一下,用实验室比较成熟的反应试剂,反应体系做一次,退火温度用软件预测一下,实际实验时退火温度再稍微低点。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
好好学习,天天向上!
12楼2013-04-28 11:03:31
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fancyxie

新虫 (正式写手)


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做个梯度PCR先检验一下引物再说
飞翔靠翅膀更靠梦想!
22楼2013-05-01 10:42:03
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普通回帖

sl35537417

木虫 (正式写手)

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gyesang: 金币+1, 鼓励发贴交流,为楼主问题解决提供可能的线索! 2013-04-27 13:49:36
什么样本?基因组DNA还是cDNA? 做温度梯度了没?
2楼2013-04-27 09:51:39
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朝着江河走

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by sl35537417 at 2013-04-27 09:51:39
什么样本?基因组DNA还是cDNA? 做温度梯度了没?

基因组DNA,没做过温度梯度,怎么做啊?谢谢
生命在于运动
3楼2013-04-27 10:15:24
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sl35537417

木虫 (正式写手)


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什么物种的基因组?真核的原核的?找个能做温度梯度的PCR仪  退火温度按照不同温度进行PCR
4楼2013-04-27 10:34:08
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朝着江河走

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by sl35537417 at 2013-04-27 10:34:08
什么物种的基因组?真核的原核的?找个能做温度梯度的PCR仪  退火温度按照不同温度进行PCR

放线菌,没做过温度PCR,一般的PCR仪可以做吗?
生命在于运动
5楼2013-04-27 10:58:46
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sl35537417

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by 朝着江河走 at 2013-04-27 10:58:46
放线菌,没做过温度PCR,一般的PCR仪可以做吗?...

不确定   如果在45-65 之间的退火温度都P不出来的话 就换引物啊
6楼2013-04-27 11:31:33
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

★ ★
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gyesang: 金币+1, 鼓励回帖应助! 2013-04-27 15:09:27
模板定浓度了吗?用同样的模板是否可以P出其他基因?LZ连引物二聚体也没有,怀疑PCR体系是否正确。此外,目的片段应该多大,PCR程序没有问题吗?这些都没问题后,优化引物的退火温度。
7楼2013-04-27 14:47:58
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jw1985629

新虫 (初入文坛)


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程序问题,引物问题。你排除下吧
i still have so much to do
8楼2013-04-27 21:01:03
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raftsman

铜虫 (正式写手)


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模板是什么
盐粒子浓度会不会太高
9楼2013-04-28 00:04:11
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dafeizizhu

铜虫 (小有名气)


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引用回帖:
5楼: Originally posted by 朝着江河走 at 2013-04-27 10:58:46
放线菌,没做过温度PCR,一般的PCR仪可以做吗?...

过程pcr仪一般都能做梯度PCR实验。
10楼2013-04-28 10:47:51
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