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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 蛋白质总量，变还是不变！？
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summer2771

木虫 (正式写手)

[交流] 蛋白质总量，变还是不变！？ 已有8人参与

请教大家的意见，经常可以看到论文中（包括学位论文），只做某些蛋白的磷酸化表达，而不做蛋白总量表达。是否可以理解为，某蛋白的总量跟内参一样，是相对恒定不变的，即便是有波动，但也并无显著性差异。由此则只要计算出磷酸化表达的相对量即可说明磷酸化率究竟是上升还是下调，从而表明该蛋白的变化。
我的实验中出现了有好多例都是各个组的蛋白总量也是有显著不同的，磷酸化表达也是不同的，我用磷酸化表达/总量表达的Ratio来说明问题，出现的趋势却可能是跟磷酸化、总量本身的变化趋势相反，即磷酸化、总量均上升，但是Ratio却可能是下调的。
看国外国内很多的论文，从条带上来看，基本上总量似乎是没有差异的。
我就有点纳闷了，难道我的实验出现了问题？
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1楼 2013-01-24 23:12:34
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summer2771

木虫 (正式写手)
另外请教大家一下，是否会出现这种情况：蛋白总量呈下降趋势，比如与对照组相比倍数为0.93、0.95倍，但是磷酸化表达却是升高的比如1.1或1.2倍
这样的话，用phospho/total，出来的倍数则会大于phospho/内参所表现出的1.1或1.2倍。
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6楼2013-01-25 11:15:48
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weebug

版主 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
应该是先统一蛋白量吧，在做磷酸化测。
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天蓝蓝兮日头晒
2楼2013-01-25 09:01:08
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zhang881007

金虫 (小有名气)
最好是做同一蛋白的总量与磷酸化后的比列变化
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shine
3楼2013-01-25 09:01:42
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wqj1988926

金虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
一般来说磷酸化的与非磷酸化的蛋白都会测定
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风雪夜归人
4楼2013-01-25 09:14:38
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