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小米椒k

铁虫 (初入文坛)

[求助] 紧急求助:SDS-PAGE上样一定要调蛋白含量吗?

大家好,我才开始做总蛋白SDS-PAGE,现在预实验已经做好了,但是不太清楚该怎么去上样来说明我论文中要表达的问题,我做果蔬保鲜,有对照和处理组2个试验组,贮藏期为30d,我想通过总蛋白电泳来看2个试验组组内和组间在整个贮藏期间的总蛋白变化,问了实验室其他跑蛋白的同学,他们都说上样前要调蛋白浓度,使每个样品上样的总蛋白含量(μg数)达到一致,是这样的吗?我做的果蔬中总蛋白含量在贮藏期和2个试验组间是有显著差异的,我想的是称取10g样品,提取处理后直接上样跑蛋白,就不调他们的蛋白含量了,因为我想如果样品中蛋白要是多的话跑出来自然条带就亮,这样想对吗?急求大家的帮助,在做蛋白上实在了解的少呀。
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dshlove

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

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那个调蛋白含量的目的是使你跑胶的条带均一。
其实你只要大致知道你的蛋白含量具体是多少,在点样的时候调整点样的量就行了。

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2楼2012-07-02 08:58:23
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小米椒k

铁虫 (初入文坛)

送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by dshlove at 2012-07-02 08:58:23
那个调蛋白含量的目的是使你跑胶的条带均一。
其实你只要大致知道你的蛋白含量具体是多少,在点样的时候调整点样的量就行了。

但是我问实验室做蛋白的师兄说要精确定量呢,好像说是如果不把2个样品的蛋白含量调的一致,就没有一个基准,无法说明条带颜色变化的情况。。。请问是这样么?
3楼2012-07-02 10:55:07
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dshlove

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-07-02 14:03:32
引用回帖:
3楼: Originally posted by 小米椒k at 2012-07-02 10:55:07
但是我问实验室做蛋白的师兄说要精确定量呢,好像说是如果不把2个样品的蛋白含量调的一致,就没有一个基准,无法说明条带颜色变化的情况。。。请问是这样么?...

基本是这样的,就比如说,你一个蛋白样里面有5ug的蛋白另一个蛋白样有10ug的蛋白,后面的条带肯定要粗一点,你就不能说后面蛋白比前面的好还是坏,只有在同等浓度,同等上样量的情况下比较,不然不就是没意义了么。
4楼2012-07-02 11:02:49
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小米椒k

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by dshlove at 2012-07-02 11:02:49
基本是这样的,就比如说,你一个蛋白样里面有5ug的蛋白另一个蛋白样有10ug的蛋白,后面的条带肯定要粗一点,你就不能说后面蛋白比前面的好还是坏,只有在同等浓度,同等上样量的情况下比较,不然不就是没意义了么。...

我每次处理样品的方法都一样,上样体积也给它规定一样,那样品的蛋白浓度高的话自然条带就粗,而不是因为我故意给它上样比对照组多。比如在贮藏第10 d,处理组样品蛋白含量本来就比对照高,且100kd大小的蛋白也比处理组多,但是我如果把处理组蛋白浓度稀释到和对照组一样的话,那100kd的蛋白也少了啊,这样的话我可能对照组和处理组之间这100kd大小的蛋白含量就没有差异了呢......不好意思,我现在脑子比较纠结,也不知道想对了没有。
5楼2012-07-02 12:47:50
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小米椒k

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by dshlove at 2012-07-02 11:02:49
基本是这样的,就比如说,你一个蛋白样里面有5ug的蛋白另一个蛋白样有10ug的蛋白,后面的条带肯定要粗一点,你就不能说后面蛋白比前面的好还是坏,只有在同等浓度,同等上样量的情况下比较,不然不就是没意义了么。...

还有就是我的目的是知道对照组比处理组蛋白多了,想知道这个过程中,是哪些大小的蛋白增多,哪些减少了。另外就是我用跑出来的图做个半定量有意义吗?非常感谢
6楼2012-07-02 12:51:00
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dshlove

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小丹木木: 金币+3, 热心的虫虫 2012-07-02 14:03:56
小米椒k: 金币+35, ★★★★★最佳答案, 清楚明了 2012-07-03 15:20:34
引用回帖:
6楼: Originally posted by 小米椒k at 2012-07-02 12:51:00
还有就是我的目的是知道对照组比处理组蛋白多了,想知道这个过程中,是哪些大小的蛋白增多,哪些减少了。另外就是我用跑出来的图做个半定量有意义吗?非常感谢...

胶跑出来的只是做个直观展示。针对你说的,你是想看你的样品中蛋白量,或者某一个蛋白随时间变化而变化的趋势对不对?
如果是这样的话,你就规定每次点样的体积(这个体积你去试,因为体积大了,蛋白量多,胶可能就难看了)然后随天数变化的样品也点一样的体积。
针对你师兄说的,“但是我问实验室做蛋白的师兄说要精确定量呢,好像说是如果不把2个样品的蛋白含量调的一致,就没有一个基准,无法说明条带颜色变化的情况。。。请问是这样么?”,这一点,你不是有实验组和对照组么,他的意思是要你每天取样的时候(假如你每天都取样)要取的实验组和对照组跑胶的时候,同一批次的上样蛋白量是要一致的。这样才能做比较。
懂了没?
7楼2012-07-02 13:07:01
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sk_yb

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小米椒k: 金币+5, 有帮助, 谢谢 2012-07-03 15:20:06
这个必须精确定量,要不然对比没有意义。
8楼2012-07-02 13:37:05
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sayaya

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

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小米椒k: 金币+20, ★★★很有帮助, 谢谢大家 2012-07-03 15:19:48
上样前是否要调蛋白浓度到一样,主要看你实验的目的。

如你所说,如果要看处理后样品的蛋白总量的变化,那就不要调蛋白浓度。因为你取样的量是一致的,这样样品中如果总蛋白含量不一样,那各自跑出来的带的亮度就会有差异。
如果你只是想看所含蛋白组分的变化,那最好调节蛋白浓度到一致,这样就能更好地显示各个组分的亮度变化来。
9楼2012-07-03 08:34:16
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小米椒k

铁虫 (初入文坛)

懂了,非常非常感谢!
10楼2012-07-03 15:14:03
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