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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 蛋白质总量，变还是不变！？
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summer2771

木虫 (正式写手)

[交流] 蛋白质总量，变还是不变！？ 已有8人参与

请教大家的意见，经常可以看到论文中（包括学位论文），只做某些蛋白的磷酸化表达，而不做蛋白总量表达。是否可以理解为，某蛋白的总量跟内参一样，是相对恒定不变的，即便是有波动，但也并无显著性差异。由此则只要计算出磷酸化表达的相对量即可说明磷酸化率究竟是上升还是下调，从而表明该蛋白的变化。
我的实验中出现了有好多例都是各个组的蛋白总量也是有显著不同的，磷酸化表达也是不同的，我用磷酸化表达/总量表达的Ratio来说明问题，出现的趋势却可能是跟磷酸化、总量本身的变化趋势相反，即磷酸化、总量均上升，但是Ratio却可能是下调的。
看国外国内很多的论文，从条带上来看，基本上总量似乎是没有差异的。
我就有点纳闷了，难道我的实验出现了问题？
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1楼 2013-01-24 23:12:34
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summer2771

木虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by ccharlien at 2013-01-25 19:59:53
如果你的处理影响到了蛋白的表达水平，就没必要盯着磷酸化做文章了
如果处理组和对照，内参总蛋白水平都一致，磷酸化水平不一致，这个处理才是针对这个磷酸化位点的，不然就不能用磷酸化去解释
你上样时把内参量 ...

我做的信号通路蛋白，如果不盯着磷酸化，光总蛋白说明不了问题啊！
我跑胶的时候，磷酸化和总蛋白不是一版胶跑的，所以各自都有一个内参，但是内参都是齐的，内参效果做的挺好的。
我是做的组织，每一样本组织的蛋白含量肯定不同，但是经过调整之后，样品浓度是4ug/ul，按照20ug的量上样。
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10楼2013-01-26 00:22:09
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weebug

版主 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
应该是先统一蛋白量吧，在做磷酸化测。
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天蓝蓝兮日头晒
2楼2013-01-25 09:01:08
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zhang881007

金虫 (小有名气)
最好是做同一蛋白的总量与磷酸化后的比列变化
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shine
3楼2013-01-25 09:01:42
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wqj1988926

金虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
一般来说磷酸化的与非磷酸化的蛋白都会测定
赞一下(1人) 回复此楼
风雪夜归人
4楼2013-01-25 09:14:38
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