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zjuwrx

银虫 (小有名气)

[求助] 关于测序结果的分析~~~~~~~~~~~~~~~~~

呃,问题有点难理解,我慢慢说~
是这样的,我做一个基因家族,9个基因,他们的保守性很好,差异位点不多。我设计了一对引物,对这个基因家族进行PCR,挑单克隆测序后,对测序结果分析,我目的想区分测序的结果属于哪一个基因?进行过比对,但因为基因的同源性很高,不是很容易区分开。各位有什么好的建议吗?我怎么样将多个测序结果分类?
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zjuwrx

银虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by tanglian8655 at 2012-08-16 11:06:01
你是得到了测序序列,想通过比对区分各个基因吧,那就做相应的序列比对不就可以了吗?有相关的网站或软件可以做比对的!

是有测序结果,要区分各个基因。手动序列比对过了,感觉有的序列是四不像,能匹配好几个基因,所有就很难处理了。你能介绍几个好的网站或软件吗?我是用的seqman
7楼2012-08-18 18:54:01
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查看全部 7 个回答

steler_ly

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
呵呵   进行等位特异PCR就可以嘛!
2楼2012-08-14 14:17:07
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woshizhufeng

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
还是得设计对这九个基因的引物啊,个人觉得不是很好设计。在其差异区设计吧,祝你好运。
3楼2012-08-15 09:11:07
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zjuwrx

银虫 (小有名气)

谢谢你的回复!这个方法对于我来说不适合,我忘了说明一点,我是设计的BSP引物,真正能作为引物的还是很少

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
4楼2012-08-15 21:35:32
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