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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 关于测序结果的分析~~~~~~~~~~~~~~~~~
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zjuwrx

银虫 (小有名气)

[求助] 关于测序结果的分析~~~~~~~~~~~~~~~~~

呃，问题有点难理解，我慢慢说~
是这样的，我做一个基因家族，9个基因，他们的保守性很好，差异位点不多。我设计了一对引物，对这个基因家族进行PCR，挑单克隆测序后，对测序结果分析，我目的想区分测序的结果属于哪一个基因？进行过比对，但因为基因的同源性很高，不是很容易区分开。各位有什么好的建议吗？我怎么样将多个测序结果分类？
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1楼 2012-08-13 21:44:44
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steler_ly

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
呵呵   进行等位特异PCR就可以嘛！
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2楼2012-08-14 14:17:07
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woshizhufeng

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
还是得设计对这九个基因的引物啊，个人觉得不是很好设计。在其差异区设计吧，祝你好运。
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3楼2012-08-15 09:11:07
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zjuwrx

银虫 (小有名气)
谢谢你的回复！这个方法对于我来说不适合，我忘了说明一点，我是设计的BSP引物，真正能作为引物的还是很少

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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4楼2012-08-15 21:35:32
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zjuwrx

银虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by woshizhufeng at 2012-08-15 09:11:07
还是得设计对这九个基因的引物啊，个人觉得不是很好设计。在其差异区设计吧，祝你好运。

谢谢！差异区太少了，不是很好设计的

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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5楼2012-08-15 21:38:49
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tanglian8655

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你是得到了测序序列，想通过比对区分各个基因吧，那就做相应的序列比对不就可以了吗?有相关的网站或软件可以做比对的！
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6楼2012-08-16 11:06:01
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zjuwrx

银虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by tanglian8655 at 2012-08-16 11:06:01
你是得到了测序序列，想通过比对区分各个基因吧，那就做相应的序列比对不就可以了吗?有相关的网站或软件可以做比对的！

是有测序结果，要区分各个基因。手动序列比对过了，感觉有的序列是四不像，能匹配好几个基因，所有就很难处理了。你能介绍几个好的网站或软件吗？我是用的seqman
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7楼2012-08-18 18:54:01
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