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tomorrowhl

新虫 (初入文坛)

[交流] 就要被蛋白质电泳(SDS-PAGE)灭了,有图有真相,望高手指点 已有21人参与

我的分离胶浓度为12,实验室其他人和我同时跑都能跑出清晰的条带。
marker和样品的量均为10微升。
左边两个是我的样,右边依次是marker、同学的样。我几经跑很多次了,每次都这样,这不是偶然,而是必然啊

我用细菌胞外产物跑PAGE,要不是没有条带,要不就是模糊的条带,maker和样品的泳道挨着就会被及变形,样品的泳道很宽,差不多是两个用到那么宽。用考马斯亮蓝测定蛋白质含量为1.78mg/ml。在电泳时会看到有黄色物质从样品泳道中析出。请各位高手指点迷津,小女子不胜感激啊!!!!

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chengjg

木虫 (正式写手)

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zhaohq1209: 金币+1, 有这种可能~ 2012-05-18 08:41:49
电泳槽是不是接触不好了 铂丝有问题 还是密封不好呀
2楼2012-05-17 19:44:30
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qjy_134

铜虫 (小有名气)


★ ★
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zhaohq1209: 金币+1, 跟样品的浓度关系应该不太大吧,关键是上样量吧 2012-05-18 08:42:16
样品缓冲液不对,还有样品浓度低
3楼2012-05-17 19:53:51
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colorfulmiao

木虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★
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amisking: 金币+4, 鼓励发帖交流问题。 2012-05-17 20:22:19
黄色的物质?是你的样品中溶剂含有影响电泳结果的物质吧?有没有试过先透析再跑电泳呢?你的蛋白浓度比较大 透析应该不会影响蛋白显色,把样品透析好再跑电泳应该就好了
还有 跑电泳前先把样品离心一下 祝成功
亦余心之所善兮虽九死其犹未悔
4楼2012-05-17 20:15:57
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tomorrowhl

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by colorfulmiao at 2012-05-17 20:15:57:
黄色的物质?是你的样品中溶剂含有影响电泳结果的物质吧?有没有试过先透析再跑电泳呢?你的蛋白浓度比较大 透析应该不会影响蛋白显色,把样品透析好再跑电泳应该就好了
还有 跑电泳前先把样品离心一下 祝成功

谢谢你的回答。
我是先盐析了蛋白,在重悬,最后透析浓缩了的
5楼2012-05-17 21:37:06
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vetzhang

金虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★
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zhaohq1209: 金币+4, 鼓励交流哈~高手初现 2012-05-18 08:42:44
黄色物质有可能是PH值不对啊,一般情况下用TCA即三氯乙酸浓缩后的蛋白,如果不用丙酮洗涤除去TCA残留,在加2倍或5倍SDS上样缓冲液前,不加一定量的NaOH中和TCA的话,用SDS样品处理液处理后的蛋白样品在上样前是黄色的。还有如果自己配置的SDS上样缓冲液,如果PH值偏低也是显示有点黄色。但是以我们的经验来看,样品PH值稍微偏低基本不影响跑样。另外TCA法浓缩蛋白跑PAGE还是很漂亮的。
还有,我们实验室曾经有表达的很多上清蛋白在经PBS透析后经PEG8000浓缩,测定蛋白样品也挺大,但是跑蛋白胶就是像楼主似的模糊一片。怀疑是PEG8000的问题影响跑样。后改为TCA浓缩后大部分解决了这一问题。但是有的蛋白用硫酸铵浓缩后跑样还是有时候呈现模糊一片。仅限于个别蛋白,猜测可能与蛋白表达量低等有关。
6楼2012-05-17 22:41:25
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stone856

银虫 (小有名气)


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你的sample buffer和你同学用的一样吗?还是你自己配的?

建议你换一换试试。
7楼2012-05-18 06:11:33
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tomorrowhl

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by vetzhang at 2012-05-17 22:41:25:
黄色物质有可能是PH值不对啊,一般情况下用TCA即三氯乙酸浓缩后的蛋白,如果不用丙酮洗涤除去TCA残留,在加2倍或5倍SDS上样缓冲液前,不加一定量的NaOH中和TCA的话,用SDS样品处理液处理后的蛋白样品在上样前是黄 ...

但是用TCA对蛋白质完整性有影响的呀?
8楼2012-05-18 09:12:32
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ybj1983

至尊木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
还是出在你的样品上,盐浓度太高?或者。。。总之你的样品透析的好像不测底
学无止境
9楼2012-05-18 09:30:43
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colorfulmiao

木虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by tomorrowhl at 2012-05-17 21:37:06:
谢谢你的回答。
我是先盐析了蛋白,在重悬,最后透析浓缩了的

蛋白电泳蛋白浓度在0.1mg/mL都可以看到清晰条带,你可以试一下透析后不浓缩直接上样电泳,我所知道的是聚乙二醇两万浓缩后对电泳条带影响很大,所以我都不浓缩只透析 继续祝成功
亦余心之所善兮虽九死其犹未悔
10楼2012-05-18 10:02:34
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