| 查看: 302 | 回复: 0 | ||
ygbxk铁杆木虫 (正式写手)
|
[求助]
DGGE系统发育树问题
|
|
小弟刚做了个DGGE，割胶测序后，现在想做一个简单的发育树。结果发现总是有几个不同纲的菌跑到一起，或者同一个纲的菌不在一起，这是什么原因？大家一般是怎么处理的啊？因为我看到人家的文章上，都是同一个纲的菌能做在一起，而我的有时候怎么也不再一起。比如说1，2，3号条带是贝塔类的变形菌，应该在发育树上可以做到一枝上，但是我的1，2号在一起，3号和1，2号之间可能有个伽玛类的变形菌。这样怎么处理啊？ 另外，DGGE是不是片段太短，所以才容易导致上述情况出现？我又做了几个克隆文库，是不是 就完全没有必要做DGGE的系统发育了？因为上次做了个DGGE，审稿人说没做发育树信息不完全，不够明确。不是这个专业的，初学，新手哦，很纠结啊。说了这么多不知道说明白没有。 |
回复此楼» 猜你喜欢
蛋白质检测：精准分析，解锁生物分子的密码
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之小鼠实验：严谨设计，解析生命机制的重要载体
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有257人回复
-
不合理蛙科研实验之重金属检测：精准筛查，守护健康与环境的防线
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“蛙测重金属我背锅三千”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复
-
纳米粒度分析
已经有3人回复
-
林科院林化所招收材料与化工专业硕士，坐标南京
已经有0人回复
-
留学--博士招生
已经有15人回复
-
化学工程，本211，求调剂，ab区不限
已经有4人回复
找到一些相关的精华帖子，希望有用哦~
向高人请教，关于构建系统发育树的，谢谢！
已经有12人回复
- 系统树如何分析
已经有9人回复
- 相似性高的菌株为什么系统发育建树后相隔很远？
已经有8人回复
- DNAMAN的单序列比对和多序列比对结果不一样
已经有4人回复
- 做进化树使用完整的DNA序列，还是一个片段？
已经有6人回复
- DGGE序列建系统发育树原序列和比对序列分离
已经有8人回复
- DGGE预电泳的问题
已经有9人回复
- bio-rad DGGE漏胶问题
已经有8人回复
- ＤＧＧＥ银染问题
已经有12人回复
- 在做系统发育树的时候，如何从genbank上选择下载同源序列呢
已经有10人回复
- DNAMAN多序列比对
已经有7人回复
- 关于怎样建立基因文库，并通过文库建系统发育树
已经有9人回复
- DGGE电泳的问题
已经有7人回复
- 请教构建系统发生树的一些问题
已经有5人回复
- 【交流】Blast比对结果解惑
已经有11人回复
- 【求助/交流】DGGE条带亮点分析
已经有12人回复
- 【求助/交流】DGGE中GC夹问题
已经有9人回复
- 【求助/交流】16S rDNA测序 系统发育树构建 急！！！
已经有6人回复
点击这里搜索更多相关资源科研从小木虫开始，人人为我，我为人人
