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q904954717

铜虫 (初入文坛)

[求助] DNAMAN的单序列比对和多序列比对结果不一样 已有1人参与

最近在学序列比对，两条序列的GenBank分别是KJ700483.1和AB847930.1。我采用DNAMAN的单序列比对和多序列比对分别做比对，结果两者的一致性结果竟然是不一样的，真是郁闷死我了，有大神能指导下是什么原因吗？

DNAMAN的单序列比对和多序列比对结果不一样
1.png


DNAMAN的单序列比对和多序列比对结果不一样-1
2.png
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1楼 2014-07-19 17:22:03
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luwei13566

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-07-27 19:26:52
上一个结果的identity是把DNAMAN1.seq的前56个bp全都算进去了。而下面那个结果明显是把DNAMAN2的前8个和DNAMAN1的前56个截去了后重新比对的。注意下面那个图identity数值后面的那个括号。
两个比对除了前6个碱基的比对稍有不同外其余的完全一样。
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

q904954717
大家相互帮助哈
2楼2014-07-19 22:52:50
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q904954717

铜虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by luwei13566 at 2014-07-19 22:52:50
上一个结果的identity是把DNAMAN1.seq的前56个bp全都算进去了。而下面那个结果明显是把DNAMAN2的前8个和DNAMAN1的前56个截去了后重新比对的。注意下面那个图identity数值后面的那个括号。
两个比对除了前6个碱基的 ...

有点看明白了，等于说：结果的identity应该是下面那个对的，是吗？
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3楼2014-07-27 18:01:02
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luwei13566

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by q904954717 at 2014-07-27 18:01:02
有点看明白了，等于说：结果的identity应该是下面那个对的，是吗？...

恩

[ 发自小木虫客户端 ]
4楼2014-07-27 18:11:28
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q904954717

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by luwei13566 at 2014-07-27 18:11:28
恩
...

谢谢谢谢，受教了。
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5楼2014-07-29 18:01:18
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