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q904954717

铜虫 (初入文坛)

[求助] DNAMAN的单序列比对和多序列比对结果不一样 已有1人参与

最近在学序列比对,两条序列的GenBank分别是KJ700483.1和AB847930.1。我采用DNAMAN的单序列比对和多序列比对分别做比对,结果两者的一致性结果竟然是不一样的,真是郁闷死我了,有大神能指导下是什么原因吗?

DNAMAN的单序列比对和多序列比对结果不一样
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DNAMAN的单序列比对和多序列比对结果不一样-1
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luwei13566

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-07-27 19:26:52
上一个结果的identity是把DNAMAN1.seq的前56个bp全都算进去了。而下面那个结果明显是把DNAMAN2的前8个和DNAMAN1的前56个截去了后重新比对的。注意下面那个图identity数值后面的那个括号。
两个比对除了前6个碱基的比对稍有不同外其余的完全一样。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

大家相互帮助哈
2楼2014-07-19 22:52:50
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q904954717

铜虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by luwei13566 at 2014-07-19 22:52:50
上一个结果的identity是把DNAMAN1.seq的前56个bp全都算进去了。而下面那个结果明显是把DNAMAN2的前8个和DNAMAN1的前56个截去了后重新比对的。注意下面那个图identity数值后面的那个括号。
两个比对除了前6个碱基的 ...

有点看明白了,等于说:结果的identity应该是下面那个对的,是吗?
3楼2014-07-27 18:01:02
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luwei13566

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by q904954717 at 2014-07-27 18:01:02
有点看明白了,等于说:结果的identity应该是下面那个对的,是吗?...



[ 发自小木虫客户端 ]
4楼2014-07-27 18:11:28
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q904954717

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by luwei13566 at 2014-07-27 18:11:28

...

谢谢谢谢,受教了。
5楼2014-07-29 18:01:18
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