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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 做进化树使用完整的DNA序列，还是一个片段？
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wangyiranmsn

新虫 (初入文坛)

[交流] 做进化树使用完整的DNA序列，还是一个片段？已有6人参与

如题。基于植物的DNA做进化树时，所需要的DNA是编码某个蛋白的完整的DNA序列（从起始密码子到终止密码子）还是只要这个DNA中的一个片段即可？大约多少个bp合适？
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1楼2014-04-18 23:02:07
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fanwq258

木虫 (正式写手)
全部cds吧
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要么好好活，要么死，拒绝半死不活
2楼2014-04-19 12:24:30
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Neo2000

木虫 (著名写手)
★
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一般都拿氨基酸序列做啦

[ 发自小木虫客户端 ]
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3楼2014-04-19 18:57:20
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飘落Oo天气

银虫 (小有名气)
★
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用氨基酸序列即可，一定要用核酸的话，建议用全序列CDS。
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dai1103
4楼2014-04-22 01:07:37
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dai1103

银虫 (小有名气)
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送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by 飘落Oo天气 at 2014-04-22 01:07:37
用氨基酸序列即可，一定要用核酸的话，建议用全序列CDS。

是全序列的CDS，临近的5‘和3’非编码区序列不需要吗？
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5楼2014-12-23 19:08:54
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ysx0226

金虫 (小有名气)
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引用回帖:
5楼: Originally posted by dai1103 at 2014-12-23 19:08:54
是全序列的CDS，临近的5‘和3’非编码区序列不需要吗？...

不需要，不过用cds 不如 用 pro
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6楼2014-12-24 15:38:17
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红卫大兵

木虫 (正式写手)
★
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你可以用蛋白质与cdna都做一下，看看结果一致性好不好。
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7楼2014-12-24 16:25:49
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