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wangyiranmsn

新虫 (初入文坛)

[交流] 做进化树使用完整的DNA序列,还是一个片段? 已有6人参与

如题。基于植物的DNA做进化树时,所需要的DNA是编码某个蛋白的完整的DNA序列(从起始密码子到终止密码子)还是只要这个DNA中的一个片段即可?大约多少个bp合适?
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fanwq258

木虫 (正式写手)

全部cds吧
要么好好活,要么死,拒绝半死不活
2楼2014-04-19 12:24:30
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Neo2000

木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
一般都拿氨基酸序列做啦

[ 发自小木虫客户端 ]
3楼2014-04-19 18:57:20
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飘落Oo天气

银虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
用氨基酸序列即可,一定要用核酸的话,建议用全序列CDS。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2014-04-22 01:07:37
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dai1103

银虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by 飘落Oo天气 at 2014-04-22 01:07:37
用氨基酸序列即可,一定要用核酸的话,建议用全序列CDS。

是全序列的CDS,临近的5‘和3’非编码区序列不需要吗?
5楼2014-12-23 19:08:54
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ysx0226

金虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by dai1103 at 2014-12-23 19:08:54
是全序列的CDS,临近的5‘和3’非编码区序列不需要吗?...

不需要,不过用cds 不如 用 pro
6楼2014-12-24 15:38:17
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红卫大兵

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你可以用蛋白质与cdna都做一下,看看结果一致性好不好。
7楼2014-12-24 16:25:49
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