| 查看: 1519 | 回复: 5 | ||
gllen009铁杆木虫 (著名写手)
|
[求助]
怎样把两个基因的序列串联起来并且生成FASAT格式？
|
 我有两问题： 一、我想把两个基因序列串联做进化树，怎样把两个基因的序列串联起来并且生成FASAT格式？（注：我有几百个序列要连接）  二、MAFFT怎样用来序列比对？  自己琢磨了半天还是没懂啊  有木有啥学习 参考资料可以提供呢  大家帮我出出主意 |
回复此楼» 猜你喜欢
不合理蛙科研实验中的趣事：实验器材的 “乌龙”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：和实验材料的 “斗智斗勇”
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有66人回复
-
蛋白质检测：精准分析，解锁生物分子的密码
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之小鼠实验：严谨设计，解析生命机制的重要载体
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之重金属检测：精准筛查，守护健康与环境的防线
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“蛙测重金属我背锅三千”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复
-
纳米粒度分析
已经有3人回复
-
林科院林化所招收材料与化工专业硕士，坐标南京
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 请问下面两个序列中是否含有Kozaka序列
已经有6人回复
- 有谁知道关于Pfrt I 质粒的信息，包括他的基因序列和含有的酶切位点。急啊
已经有4人回复
- 大侠们，我有一个2kb左右的基因，但我想寻找上下游的序列，改咋做呢？
已经有8人回复
- 原核表达大的核苷酸序列容易表达吗？
已经有3人回复
- 两个基因融合不起来
已经有13人回复
- 如何根据DNA测序来判断蛋白质的序列呢？
已经有9人回复
- 【求助】无限长序列
已经有3人回复
- 求助 基因工程菌保藏问题
已经有11人回复
chenguestc
木虫 (职业作家)
- MolEPI: 7
- 应助: 576 (博士)
- 贵宾: 0.4
- 金币: 4526.9
- 散金: 1639
- 红花: 176
- 帖子: 4708
- 在线: 353.5小时
- 虫号: 1337860
- 注册: 2011-07-05
- 性别: GG
- 专业: 作物分子育种
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★
amisking(金币+5): 鼓励应助。 2011-09-29 21:32:52
amisking(金币+5): 鼓励应助。 2011-09-29 21:32:52
|
具体拼接引自小木虫原来的帖子（http://muchong.com/html/201101/2742400.html ），内容如下： 打开DANMAN，sequence菜单下选择sequence assembly，然后在add file中加入待拼接的2条序列，点assemble，然后点show result，最后export consensus sequence得到拼接好的序列。 有时需要将其中的一个序列存成Reverse and Complement 的形式，再拼接才是正确的 然后，将拼接序列输入到MEGA4打开，然后保存成FASTA格式即可。 方法有点麻烦，如果其他虫子有好方法多发言。 |
2楼2011-09-29 19:04:12
gllen009
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 11 (小学生)
- 金币: 6592.4
- 散金: 1014
- 红花: 14
- 帖子: 2434
- 在线: 249.9小时
- 虫号: 992137
- 注册: 2010-04-08
- 专业: 污染控制化学
3楼2011-09-30 09:27:05
gllen009
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 11 (小学生)
- 金币: 6592.4
- 散金: 1014
- 红花: 14
- 帖子: 2434
- 在线: 249.9小时
- 虫号: 992137
- 注册: 2010-04-08
- 专业: 污染控制化学
4楼2011-09-30 09:34:38
gllen009
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 11 (小学生)
- 金币: 6592.4
- 散金: 1014
- 红花: 14
- 帖子: 2434
- 在线: 249.9小时
- 虫号: 992137
- 注册: 2010-04-08
- 专业: 污染控制化学
5楼2011-09-30 09:45:14
chenguestc
木虫 (职业作家)
- MolEPI: 7
- 应助: 576 (博士)
- 贵宾: 0.4
- 金币: 4526.9
- 散金: 1639
- 红花: 176
- 帖子: 4708
- 在线: 353.5小时
- 虫号: 1337860
- 注册: 2011-07-05
- 性别: GG
- 专业: 作物分子育种
6楼2011-09-30 13:39:46
50