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gllen009铁杆木虫 (著名写手)
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怎样把两个基因的序列串联起来并且生成FASAT格式?
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![]() 我有两问题: 一、我想把两个基因序列串联做进化树,怎样把两个基因的序列串联起来并且生成FASAT格式?(注:我有几百个序列要连接) ![]() 二、MAFFT怎样用来序列比对? 自己琢磨了半天还是没懂啊 有木有啥学习 参考资料可以提供呢 ![]() 大家帮我出出主意 ![]() ![]() |
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【答案】应助回帖
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amisking(金币+5): 鼓励应助。 2011-09-29 21:32:52
amisking(金币+5): 鼓励应助。 2011-09-29 21:32:52
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具体拼接引自小木虫原来的帖子(http://muchong.com/html/201101/2742400.html ),内容如下: 打开DANMAN,sequence菜单下选择sequence assembly,然后在add file中加入待拼接的2条序列,点assemble,然后点show result,最后export consensus sequence得到拼接好的序列。 有时需要将其中的一个序列存成Reverse and Complement 的形式,再拼接才是正确的 然后,将拼接序列输入到MEGA4打开,然后保存成FASTA格式即可。 方法有点麻烦,如果其他虫子有好方法多发言。 |
2楼2011-09-29 19:04:12
gllen009
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5楼2011-09-30 09:45:14
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6楼2011-09-30 13:39:46












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