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gllen009铁杆木虫 (著名写手)
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怎样把两个基因的序列串联起来并且生成FASAT格式？
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 我有两问题： 一、我想把两个基因序列串联做进化树，怎样把两个基因的序列串联起来并且生成FASAT格式？（注：我有几百个序列要连接）  二、MAFFT怎样用来序列比对？  自己琢磨了半天还是没懂啊  有木有啥学习 参考资料可以提供呢  大家帮我出出主意 |
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chenguestc
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6楼2011-09-30 13:39:46
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【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★
amisking(金币+5): 鼓励应助。 2011-09-29 21:32:52
amisking(金币+5): 鼓励应助。 2011-09-29 21:32:52
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具体拼接引自小木虫原来的帖子（http://muchong.com/html/201101/2742400.html ），内容如下： 打开DANMAN，sequence菜单下选择sequence assembly，然后在add file中加入待拼接的2条序列，点assemble，然后点show result，最后export consensus sequence得到拼接好的序列。 有时需要将其中的一个序列存成Reverse and Complement 的形式，再拼接才是正确的 然后，将拼接序列输入到MEGA4打开，然后保存成FASTA格式即可。 方法有点麻烦，如果其他虫子有好方法多发言。 |
2楼2011-09-29 19:04:12
gllen009
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3楼2011-09-30 09:27:05
gllen009
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4楼2011-09-30 09:34:38
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