应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 请教构建系统发生树的一些问题
61/1返回列表
查看: 1060  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

微笑生活

铜虫 (小有名气)

[求助] 请教构建系统发生树的一些问题

请问构建系统发生树时，若节点支持率很低怎么办？另外，能不能只取各个物种中相同的某一段序列进行构树，若有高手，请不吝赐教，谢谢！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2011-05-10 20:57:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

疯狂修行者

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
微笑生活(金币+5): 谢谢 2011-05-11 10:46:13
lstt09nk(金币+2): 感谢交流 2011-05-11 18:53:56
只取各个物种中相同的某一段序列进行构树应该是可以的。你做的是微生物还是其他的，细菌一般用16S的序列，真菌用18S序列，再就是用线粒体序列，这些序列的引物，大家用的都差不多，都是一段序列的啊。
赞一下(1人) 回复此楼
戒骄戒躁，坦荡做人，平常心做事，享受生活之美！！
2楼2011-05-11 09:33:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

微笑生活

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by 疯狂修行者 at 2011-05-11 09:33:20:
只取各个物种中相同的某一段序列进行构树应该是可以的。你做的是微生物还是其他的，细菌一般用16S的序列，真菌用18S序列，再就是用线粒体序列，这些序列的引物，大家用的都差不多，都是一段序列的啊。

谢谢，我做的是无脊椎的后生动物，现在是想构建一个蛋白酶的系统发生树，但是有的物种序列长度缺了一段，所以就想是不是只取大家都有的那一段也行
赞一下 回复此楼
3楼2011-05-11 10:50:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

疯狂修行者

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

微笑生活(金币+5): 谢谢 2011-05-12 12:16:13
引用回帖:
Originally posted by 微笑生活 at 2011-05-11 10:50:28:
谢谢，我做的是无脊椎的后生动物，现在是想构建一个蛋白酶的系统发生树，但是有的物种序列长度缺了一段，所以就想是不是只取大家都有的那一段也行

应该是可以，你说的蛋白酶我不太了解，但是应该是取大家都使用的。因为构建系统发育树要选用较保守的序列部分，这样才能比较亲缘关系，大家都使用的，应该是比较保守吧。你最好查些相关的综述或者相关的硕士博士论文，应该都会有介绍的。
赞一下 回复此楼
戒骄戒躁，坦荡做人，平常心做事，享受生活之美！！
4楼2011-05-12 08:38:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

微笑生活

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by 疯狂修行者 at 2011-05-12 08:38:13:
应该是可以，你说的蛋白酶我不太了解，但是应该是取大家都使用的。因为构建系统发育树要选用较保守的序列部分，这样才能比较亲缘关系，大家都使用的，应该是比较保守吧。你最好查些相关的综述或者相关的硕士博 ...

谢谢你！这个酶是大家都使用的，只是有个别物种这个序列还没测完全。所以我担心会影响结果
赞一下 回复此楼
5楼2011-05-12 09:10:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

uuu555000

捐助贵宾 (正式写手)
学到了不少
回复此楼
无所谓好或不好，人生一场虚空大梦，韶华白首，不过转瞬，惟有天道恒在，往复循环，不曾更改
6楼2011-07-04 20:04:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 微笑生活 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 323求调剂 +6 洼小桶 2026-03-18 6/300 2026-03-23 00:29 by king123！
[考研] 263求调剂 +4 yqdszhdap－ 2026-03-22 4/200 2026-03-22 21:20 by 1144970272
[考研] 315分，诚求调剂，材料与化工085600 +3 13756423260 2026-03-22 3/150 2026-03-22 20:11 by edmund7
[考研] 289材料与化工（085600）B区求调剂 +3 这么名字咋样 2026-03-22 4/200 2026-03-22 17:56 by 云民大李老师
[考研] 一志愿华中农业071010，总分320求调剂 +5 困困困困坤坤 2026-03-20 6/300 2026-03-22 17:41 by hxsm
[考研] 求调剂院校信息 +6 CX 330 2026-03-21 6/300 2026-03-22 15:25 by 无懈可击111
[考研] 能源材料化学课题组招收硕士研究生8-10名 +5 脱颖而出 2026-03-16 17/850 2026-03-22 15:18 by 脱颖而出
[考研] 303求调剂 +5 安忆灵 2026-03-22 6/300 2026-03-22 12:46 by 素颜倾城1988
[考研] 一志愿华中科技大学071000，求调剂 +4 沿岸有贝壳6 2026-03-21 4/200 2026-03-22 07:21 by ilovexiaobin
[考研] 一志愿东华大学控制学硕320求调剂 +3 Grand777 2026-03-21 3/150 2026-03-21 19:23 by 简之-
[考研] 【考研调剂】化学专业 281分，一志愿四川大学，诚心求调剂 +11 吃吃吃才有意义 2026-03-19 11/550 2026-03-21 18:23 by 学员8dgXkO
[考研] 297求调剂 +11 戏精丹丹丹 2026-03-17 12/600 2026-03-21 17:47 by ColorlessPI
[考研] 一志愿山大07化学 332分 四六级已过 本科山东双非 求调剂！ +3 不想理你 2026-03-16 3/150 2026-03-21 03:59 by JourneyLucky
[考研] 南京大学化学376求调剂 +3 hisfailed 2026-03-19 6/300 2026-03-20 23:43 by hisfailed
[考研] 材料学求调剂 +4 Stella_Yao 2026-03-20 4/200 2026-03-20 20:28 by ms629
[考研] 求调剂 +3 @taotao 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:35 by JourneyLucky
[考研] 08工学调剂 +5 用户573181 2026-03-20 5/250 2026-03-20 15:47 by xia_2003
[考研] 招收调剂硕士 +4 lidianxing 2026-03-19 12/600 2026-03-20 12:25 by lidianxing
[考研] 085410人工智能专硕317求调剂（0854都可以） +4 xbxudjdn 2026-03-18 4/200 2026-03-20 09:07 by 不168
[考研] 344求调剂 +6 knight344 2026-03-16 7/350 2026-03-18 20:13 by walc
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭