应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 请教构建系统发生树的一些问题
61/1返回列表
查看: 1336  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

微笑生活

铜虫 (小有名气)

[求助] 请教构建系统发生树的一些问题

请问构建系统发生树时，若节点支持率很低怎么办？另外，能不能只取各个物种中相同的某一段序列进行构树，若有高手，请不吝赐教，谢谢！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2011-05-10 20:57:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

疯狂修行者

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
微笑生活(金币+5): 谢谢 2011-05-11 10:46:13
lstt09nk(金币+2): 感谢交流 2011-05-11 18:53:56
只取各个物种中相同的某一段序列进行构树应该是可以的。你做的是微生物还是其他的，细菌一般用16S的序列，真菌用18S序列，再就是用线粒体序列，这些序列的引物，大家用的都差不多，都是一段序列的啊。
赞一下(1人) 回复此楼
戒骄戒躁，坦荡做人，平常心做事，享受生活之美！！
2楼2011-05-11 09:33:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

微笑生活

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by 疯狂修行者 at 2011-05-11 09:33:20:
只取各个物种中相同的某一段序列进行构树应该是可以的。你做的是微生物还是其他的，细菌一般用16S的序列，真菌用18S序列，再就是用线粒体序列，这些序列的引物，大家用的都差不多，都是一段序列的啊。

谢谢，我做的是无脊椎的后生动物，现在是想构建一个蛋白酶的系统发生树，但是有的物种序列长度缺了一段，所以就想是不是只取大家都有的那一段也行
赞一下 回复此楼
3楼2011-05-11 10:50:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

疯狂修行者

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

微笑生活(金币+5): 谢谢 2011-05-12 12:16:13
引用回帖:
Originally posted by 微笑生活 at 2011-05-11 10:50:28:
谢谢，我做的是无脊椎的后生动物，现在是想构建一个蛋白酶的系统发生树，但是有的物种序列长度缺了一段，所以就想是不是只取大家都有的那一段也行

应该是可以，你说的蛋白酶我不太了解，但是应该是取大家都使用的。因为构建系统发育树要选用较保守的序列部分，这样才能比较亲缘关系，大家都使用的，应该是比较保守吧。你最好查些相关的综述或者相关的硕士博士论文，应该都会有介绍的。
赞一下 回复此楼
戒骄戒躁，坦荡做人，平常心做事，享受生活之美！！
4楼2011-05-12 08:38:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

微笑生活

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by 疯狂修行者 at 2011-05-12 08:38:13:
应该是可以，你说的蛋白酶我不太了解，但是应该是取大家都使用的。因为构建系统发育树要选用较保守的序列部分，这样才能比较亲缘关系，大家都使用的，应该是比较保守吧。你最好查些相关的综述或者相关的硕士博 ...

谢谢你！这个酶是大家都使用的，只是有个别物种这个序列还没测完全。所以我担心会影响结果
赞一下 回复此楼
5楼2011-05-12 09:10:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

uuu555000

捐助贵宾 (正式写手)
学到了不少
回复此楼
无所谓好或不好，人生一场虚空大梦，韶华白首，不过转瞬，惟有天道恒在，往复循环，不曾更改
6楼2011-07-04 20:04:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 微笑生活 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 5/250 2026-11-07 08:24 by byEJ59EAM6hR
[公派出国] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +8 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 23/1150 2026-11-07 06:49 by Equinoxhua
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 11/550 2026-11-06 16:32 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 10/500 2026-11-06 16:12 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +6 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 12/600 2026-11-06 16:10 by 5sJFDKp2kwuI
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +6 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 11/550 2026-11-06 13:47 by BkA9Bi5cMhkD
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +7 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 14/700 2026-11-06 13:47 by BkA9Bi5cMhkD
[考研] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +8 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 18/900 2026-11-06 13:36 by BkA9Bi5cMhkD
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +8 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 14/700 2026-11-06 13:36 by BkA9Bi5cMhkD
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 10/500 2026-11-06 05:32 by qL1cU46YIdK0
[考研] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 14/700 2026-11-06 05:11 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 kvewwGtKktqB 2026-11-04 11/550 2026-11-06 05:10 by qL1cU46YIdK0
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 kvewwGtKktqB 2026-11-04 14/700 2026-11-06 05:10 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 12/600 2026-11-06 04:47 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 8/400 2026-11-06 02:24 by qL1cU46YIdK0
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 9/450 2026-11-06 02:15 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 7/350 2026-11-06 02:13 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 9/450 2026-11-06 02:02 by qL1cU46YIdK0
[考研] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 12/600 2026-11-06 01:42 by qL1cU46YIdK0
[基金申请] 各位基础老师们，看完中央《从严治党》的决定后，对学术界更加有信心了吧 +5 iaeyuan 2026-11-01 5/250 2026-11-04 14:43 by jinchengzi
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭