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PCR程序设置
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1397717
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]
PCR程序设置
现在在做一个PCR扩增实验,引物和DNA都有,请问如何设置PCR程序?
Tm值在引物设计的时候已经确定了,扩增片段大小分别为431bp和671bp,那延伸时间和循环次数如何确定? 谢谢!
[
Last edited by 1397717 on 2012-3-5 at 14:26
]
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1楼
2012-03-05 14:22:53
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纸船
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【答案】应助回帖
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很有帮助 2012-03-06 09:58:02
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很有帮助 2012-03-06 09:58:19
1397717(金币+5):
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很有帮助 2012-03-06 09:59:24
退火温度跟理论Tm值是有差别的,建议做下梯度PCR,你这么长的片段,延伸30S足够了,循环次数建议30-35.
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4楼
2012-03-05 15:11:46
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chubing
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专业: 细胞生物学研究中的新方法
【答案】应助回帖
感谢参与,应助指数 +1
普通pcr一般延伸时间是1imin.30-35个循环。
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2楼
2012-03-05 14:44:58
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ZOEY21
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专业: 生态学
【答案】应助回帖
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很有帮助 2012-03-06 09:57:52
小丹木木(金币+1): 鼓励应助 2012-03-06 10:58:58
即使你设计引物时确定了Tm值,正式试验时还是要摸索,这很重要。一般比引物合成报告单给出的低5度。建议你还是做个退火温度的梯度试验摸索下。
延伸时间和循环数个人觉得不是影响PCR的关键。你可以参照前人做的类似物种采取的反应程序。过多容易产生非特异带,过少产物不足。
一点拙见,不对地方请指正。
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3楼
2012-03-05 14:56:44
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cgspider
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专业: 食品科学基础
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西瓜(金币+2): 鼓励应助 2012-03-07 12:13:57
500左右的片段。
94度 30s
退火 30s
72度 1min 32个循环就可以了。。
看结果,然后调整退火温度。。。
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你的能力撑不起你的野心
5楼
2012-03-05 15:20:21
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