应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 【交流】Blast比对结果解惑
51/1返回列表
查看: 1733  |  回复: 11
只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

vs570588

木虫 (正式写手)

[交流] 【交流】Blast比对结果解惑

我自己混合富集的硫自养高氯酸盐还原菌，经过PCR-DGGE,克隆测序后，现在在NCBI上比对，建发育树，但是克隆的几乎40个样品，比对结果都是和非培养的其它菌种能对上，这是啥原因？难道因为是NCBI上上传的这种类型的纯菌太少，或者研究比较少，目前大家都在做混合的？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼2011-04-17 12:57:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

vs570588

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 惟我独尊 at 2011-04-20 16:54:25:
对，换引物的话效果肯定好，但是DGGE图谱没有 200bp的漂亮。

那你说建系统发育树时，以现在200bp找外源微生物怎样考虑？
赞一下 回复此楼
8楼2011-04-20 20:44:22
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答

vs570588

木虫 (正式写手)
为啥没有人回复呢
赞一下 回复此楼
2楼2011-04-17 21:11:08
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

haitian0625

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
非目的菌？和其他菌的亲缘就是很近？再就是呈递的此菌序列少：我以为。
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2011-04-18 08:55:53
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

vs570588

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by haitian0625 at 2011-04-18 08:55:53:
非目的菌？和其他菌的亲缘就是很近？再就是呈递的此菌序列少：我以为。

由于我做的混合菌，出来后测序结果和已知纯菌的序列根本就对不上，但是我的目的基因也归不到常见的两个属中。到时和那些非培养的未命名的一些已知序列可以对上号。但这就牵涉到怎样选择外部菌种。
赞一下 回复此楼
4楼2011-04-19 13:09:11
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复(可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭